Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TM6SF1Q9BZW5 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TM6SF1Q9BZW5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TM6SF1Q9BZW5 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TM6SF1Q9BZW5 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TM6SF1Q9BZW5 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TM6SF1Q9BZW5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TM6SF1Q9BZW5 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TM6SF1Q9BZW5 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TM6SF1Q9BZW5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TM6SF1Q9BZW5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TM6SF1Q9BZW5 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TM6SF1Q9BZW5 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TM6SF1Q9BZW5 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TM6SF1Q9BZW5 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TM6SF1Q9BZW5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TM6SF1Q9BZW5 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TM6SF1Q9BZW5 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TM6SF1Q9BZW5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TM6SF1Q9BZW5 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
TM6SF1Q9BZW5 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TM6SF1Q9BZW5 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TM6SF1Q9BZW5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TM6SF1Q9BZW5 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TM6SF1Q9BZW5 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TM6SF1Q9BZW5 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TM6SF1Q9BZW5 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TM6SF1Q9BZW5 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TM6SF1Q9BZW5 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TM6SF1Q9BZW5 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TM6SF1Q9BZW5 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TM6SF1Q9BZW5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TM6SF1Q9BZW5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
TM6SF1Q9BZW5 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TM6SF1Q9BZW5 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TM6SF1Q9BZW5 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
TM6SF1Q9BZW5 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TM6SF1Q9BZW5 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TM6SF1Q9BZW5 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TM6SF1Q9BZW5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
TM6SF1Q9BZW5 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TM6SF1Q9BZW5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TM6SF1Q9BZW5 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TM6SF1Q9BZW5 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TM6SF1Q9BZW5 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
TM6SF1Q9BZW5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TM6SF1Q9BZW5 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TM6SF1Q9BZW5 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TM6SF1Q9BZW5 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TM6SF1Q9BZW5 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TM6SF1Q9BZW5 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TM6SF1Q9BZW5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TM6SF1Q9BZW5 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TM6SF1Q9BZW5 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TM6SF1Q9BZW5 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TM6SF1Q9BZW5 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TM6SF1Q9BZW5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TM6SF1Q9BZW5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TM6SF1Q9BZW5 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TM6SF1Q9BZW5 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TM6SF1Q9BZW5 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TM6SF1Q9BZW5 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TM6SF1Q9BZW5 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TM6SF1Q9BZW5 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TM6SF1Q9BZW5 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TM6SF1Q9BZW5 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
TM6SF1Q9BZW5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TM6SF1Q9BZW5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TM6SF1Q9BZW5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TM6SF1Q9BZW5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TM6SF1Q9BZW5 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TM6SF1Q9BZW5 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TM6SF1Q9BZW5 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TM6SF1Q9BZW5 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TM6SF1Q9BZW5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TM6SF1Q9BZW5 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TM6SF1Q9BZW5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TM6SF1Q9BZW5 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TM6SF1Q9BZW5 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TM6SF1Q9BZW5 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TM6SF1Q9BZW5 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TM6SF1Q9BZW5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TM6SF1Q9BZW5 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TM6SF1Q9BZW5 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TM6SF1Q9BZW5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TM6SF1Q9BZW5 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TM6SF1Q9BZW5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TM6SF1Q9BZW5 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TM6SF1Q9BZW5 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TM6SF1Q9BZW5 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TM6SF1Q9BZW5 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TM6SF1Q9BZW5 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TM6SF1Q9BZW5 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TM6SF1Q9BZW5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TM6SF1Q9BZW5 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TM6SF1Q9BZW5 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TM6SF1Q9BZW5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TM6SF1Q9BZW5 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TM6SF1Q9BZW5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TM6SF1Q9BZW5 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
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