Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXJ4

C1QTNF3, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3Q9BXJ4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C1QTNF3Q9BXJ4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C1QTNF3Q9BXJ4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
C1QTNF3Q9BXJ4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C1QTNF3Q9BXJ4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C1QTNF3Q9BXJ4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C1QTNF3Q9BXJ4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
C1QTNF3Q9BXJ4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C1QTNF3Q9BXJ4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C1QTNF3Q9BXJ4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C1QTNF3Q9BXJ4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C1QTNF3Q9BXJ4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C1QTNF3Q9BXJ4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C1QTNF3Q9BXJ4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C1QTNF3Q9BXJ4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
C1QTNF3Q9BXJ4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C1QTNF3Q9BXJ4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C1QTNF3Q9BXJ4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C1QTNF3Q9BXJ4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C1QTNF3Q9BXJ4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C1QTNF3Q9BXJ4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C1QTNF3Q9BXJ4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C1QTNF3Q9BXJ4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C1QTNF3Q9BXJ4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C1QTNF3Q9BXJ4 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C1QTNF3Q9BXJ4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C1QTNF3Q9BXJ4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C1QTNF3Q9BXJ4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C1QTNF3Q9BXJ4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C1QTNF3Q9BXJ4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C1QTNF3Q9BXJ4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C1QTNF3Q9BXJ4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C1QTNF3Q9BXJ4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C1QTNF3Q9BXJ4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C1QTNF3Q9BXJ4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
C1QTNF3Q9BXJ4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
C1QTNF3Q9BXJ4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C1QTNF3Q9BXJ4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C1QTNF3Q9BXJ4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C1QTNF3Q9BXJ4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C1QTNF3Q9BXJ4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C1QTNF3Q9BXJ4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C1QTNF3Q9BXJ4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C1QTNF3Q9BXJ4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C1QTNF3Q9BXJ4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C1QTNF3Q9BXJ4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C1QTNF3Q9BXJ4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C1QTNF3Q9BXJ4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C1QTNF3Q9BXJ4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C1QTNF3Q9BXJ4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C1QTNF3Q9BXJ4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C1QTNF3Q9BXJ4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C1QTNF3Q9BXJ4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C1QTNF3Q9BXJ4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C1QTNF3Q9BXJ4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C1QTNF3Q9BXJ4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
C1QTNF3Q9BXJ4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C1QTNF3Q9BXJ4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1QTNF3Q9BXJ4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1QTNF3Q9BXJ4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1QTNF3Q9BXJ4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1QTNF3Q9BXJ4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1QTNF3Q9BXJ4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1QTNF3Q9BXJ4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1QTNF3Q9BXJ4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1QTNF3Q9BXJ4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
C1QTNF3Q9BXJ4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
C1QTNF3Q9BXJ4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1QTNF3Q9BXJ4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1QTNF3Q9BXJ4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1QTNF3Q9BXJ4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1QTNF3Q9BXJ4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1QTNF3Q9BXJ4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
C1QTNF3Q9BXJ4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1QTNF3Q9BXJ4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1QTNF3Q9BXJ4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1QTNF3Q9BXJ4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1QTNF3Q9BXJ4 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1QTNF3Q9BXJ4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1QTNF3Q9BXJ4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1QTNF3Q9BXJ4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1QTNF3Q9BXJ4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1QTNF3Q9BXJ4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1QTNF3Q9BXJ4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1QTNF3Q9BXJ4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1QTNF3Q9BXJ4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1QTNF3Q9BXJ4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
C1QTNF3Q9BXJ4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
C1QTNF3Q9BXJ4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1QTNF3Q9BXJ4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1QTNF3Q9BXJ4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1QTNF3Q9BXJ4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1QTNF3Q9BXJ4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1QTNF3Q9BXJ4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
C1QTNF3Q9BXJ4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1QTNF3Q9BXJ4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1QTNF3Q9BXJ4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1QTNF3Q9BXJ4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1QTNF3Q9BXJ4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1QTNF3Q9BXJ4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms