Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VN1R3Q9BXE9 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VN1R3Q9BXE9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VN1R3Q9BXE9 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VN1R3Q9BXE9 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VN1R3Q9BXE9 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VN1R3Q9BXE9 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VN1R3Q9BXE9 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VN1R3Q9BXE9 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VN1R3Q9BXE9 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VN1R3Q9BXE9 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VN1R3Q9BXE9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VN1R3Q9BXE9 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VN1R3Q9BXE9 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VN1R3Q9BXE9 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VN1R3Q9BXE9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VN1R3Q9BXE9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VN1R3Q9BXE9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VN1R3Q9BXE9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VN1R3Q9BXE9 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VN1R3Q9BXE9 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VN1R3Q9BXE9 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VN1R3Q9BXE9 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VN1R3Q9BXE9 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VN1R3Q9BXE9 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VN1R3Q9BXE9 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VN1R3Q9BXE9 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VN1R3Q9BXE9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VN1R3Q9BXE9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
VN1R3Q9BXE9 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
VN1R3Q9BXE9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
VN1R3Q9BXE9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
VN1R3Q9BXE9 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
VN1R3Q9BXE9 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VN1R3Q9BXE9 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VN1R3Q9BXE9 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VN1R3Q9BXE9 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VN1R3Q9BXE9 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VN1R3Q9BXE9 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VN1R3Q9BXE9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VN1R3Q9BXE9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
VN1R3Q9BXE9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VN1R3Q9BXE9 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VN1R3Q9BXE9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VN1R3Q9BXE9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VN1R3Q9BXE9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
VN1R3Q9BXE9 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VN1R3Q9BXE9 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VN1R3Q9BXE9 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VN1R3Q9BXE9 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VN1R3Q9BXE9 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VN1R3Q9BXE9 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VN1R3Q9BXE9 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VN1R3Q9BXE9 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VN1R3Q9BXE9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
VN1R3Q9BXE9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VN1R3Q9BXE9 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VN1R3Q9BXE9 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VN1R3Q9BXE9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VN1R3Q9BXE9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VN1R3Q9BXE9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VN1R3Q9BXE9 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VN1R3Q9BXE9 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VN1R3Q9BXE9 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VN1R3Q9BXE9 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
VN1R3Q9BXE9 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VN1R3Q9BXE9 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VN1R3Q9BXE9 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VN1R3Q9BXE9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VN1R3Q9BXE9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VN1R3Q9BXE9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
VN1R3Q9BXE9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VN1R3Q9BXE9 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VN1R3Q9BXE9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VN1R3Q9BXE9 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VN1R3Q9BXE9 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VN1R3Q9BXE9 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VN1R3Q9BXE9 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VN1R3Q9BXE9 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VN1R3Q9BXE9 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VN1R3Q9BXE9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VN1R3Q9BXE9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VN1R3Q9BXE9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VN1R3Q9BXE9 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VN1R3Q9BXE9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VN1R3Q9BXE9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VN1R3Q9BXE9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VN1R3Q9BXE9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VN1R3Q9BXE9 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VN1R3Q9BXE9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VN1R3Q9BXE9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VN1R3Q9BXE9 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VN1R3Q9BXE9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VN1R3Q9BXE9 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VN1R3Q9BXE9 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VN1R3Q9BXE9 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VN1R3Q9BXE9 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VN1R3Q9BXE9 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VN1R3Q9BXE9 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
VN1R3Q9BXE9 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms