Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVW6

SMIM2, Small integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM2Q9BVW6 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM2Q9BVW6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM2Q9BVW6 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM2Q9BVW6 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM2Q9BVW6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM2Q9BVW6 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM2Q9BVW6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM2Q9BVW6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM2Q9BVW6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM2Q9BVW6 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM2Q9BVW6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM2Q9BVW6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM2Q9BVW6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM2Q9BVW6 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM2Q9BVW6 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM2Q9BVW6 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM2Q9BVW6 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM2Q9BVW6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM2Q9BVW6 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM2Q9BVW6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM2Q9BVW6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM2Q9BVW6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM2Q9BVW6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM2Q9BVW6 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM2Q9BVW6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM2Q9BVW6 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM2Q9BVW6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM2Q9BVW6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM2Q9BVW6 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM2Q9BVW6 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM2Q9BVW6 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM2Q9BVW6 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM2Q9BVW6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM2Q9BVW6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM2Q9BVW6 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM2Q9BVW6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM2Q9BVW6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM2Q9BVW6 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM2Q9BVW6 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM2Q9BVW6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM2Q9BVW6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM2Q9BVW6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM2Q9BVW6 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM2Q9BVW6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM2Q9BVW6 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM2Q9BVW6 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM2Q9BVW6 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM2Q9BVW6 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM2Q9BVW6 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM2Q9BVW6 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM2Q9BVW6 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM2Q9BVW6 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM2Q9BVW6 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM2Q9BVW6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM2Q9BVW6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM2Q9BVW6 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM2Q9BVW6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM2Q9BVW6 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM2Q9BVW6 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM2Q9BVW6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM2Q9BVW6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM2Q9BVW6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM2Q9BVW6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM2Q9BVW6 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM2Q9BVW6 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM2Q9BVW6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM2Q9BVW6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM2Q9BVW6 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM2Q9BVW6 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM2Q9BVW6 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM2Q9BVW6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM2Q9BVW6 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM2Q9BVW6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM2Q9BVW6 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM2Q9BVW6 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM2Q9BVW6 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM2Q9BVW6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM2Q9BVW6 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM2Q9BVW6 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM2Q9BVW6 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM2Q9BVW6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM2Q9BVW6 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SMIM2Q9BVW6 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SMIM2Q9BVW6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
SMIM2Q9BVW6 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM2Q9BVW6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM2Q9BVW6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM2Q9BVW6 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM2Q9BVW6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM2Q9BVW6 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM2Q9BVW6 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM2Q9BVW6 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM2Q9BVW6 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM2Q9BVW6 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM2Q9BVW6 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM2Q9BVW6 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM2Q9BVW6 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM2Q9BVW6 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM2Q9BVW6 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM2Q9BVW6 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126 ms