Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV40

VAMP8, Vesicle-associated membrane protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP8Q9BV40 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VAMP8Q9BV40 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VAMP8Q9BV40 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VAMP8Q9BV40 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VAMP8Q9BV40 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VAMP8Q9BV40 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VAMP8Q9BV40 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VAMP8Q9BV40 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VAMP8Q9BV40 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VAMP8Q9BV40 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VAMP8Q9BV40 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VAMP8Q9BV40 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VAMP8Q9BV40 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VAMP8Q9BV40 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VAMP8Q9BV40 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VAMP8Q9BV40 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VAMP8Q9BV40 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VAMP8Q9BV40 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VAMP8Q9BV40 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VAMP8Q9BV40 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VAMP8Q9BV40 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VAMP8Q9BV40 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VAMP8Q9BV40 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VAMP8Q9BV40 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VAMP8Q9BV40 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VAMP8Q9BV40 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VAMP8Q9BV40 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VAMP8Q9BV40 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VAMP8Q9BV40 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VAMP8Q9BV40 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
VAMP8Q9BV40 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VAMP8Q9BV40 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VAMP8Q9BV40 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VAMP8Q9BV40 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VAMP8Q9BV40 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VAMP8Q9BV40 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VAMP8Q9BV40 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VAMP8Q9BV40 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VAMP8Q9BV40 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VAMP8Q9BV40 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VAMP8Q9BV40 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VAMP8Q9BV40 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VAMP8Q9BV40 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VAMP8Q9BV40 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VAMP8Q9BV40 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VAMP8Q9BV40 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VAMP8Q9BV40 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VAMP8Q9BV40 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VAMP8Q9BV40 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VAMP8Q9BV40 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VAMP8Q9BV40 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VAMP8Q9BV40 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
VAMP8Q9BV40 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
VAMP8Q9BV40 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VAMP8Q9BV40 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
VAMP8Q9BV40 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VAMP8Q9BV40 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
VAMP8Q9BV40 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VAMP8Q9BV40 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VAMP8Q9BV40 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VAMP8Q9BV40 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VAMP8Q9BV40 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAMP8Q9BV40 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAMP8Q9BV40 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAMP8Q9BV40 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAMP8Q9BV40 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAMP8Q9BV40 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAMP8Q9BV40 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAMP8Q9BV40 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAMP8Q9BV40 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAMP8Q9BV40 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAMP8Q9BV40 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAMP8Q9BV40 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAMP8Q9BV40 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAMP8Q9BV40 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAMP8Q9BV40 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAMP8Q9BV40 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAMP8Q9BV40 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAMP8Q9BV40 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAMP8Q9BV40 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAMP8Q9BV40 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAMP8Q9BV40 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAMP8Q9BV40 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAMP8Q9BV40 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAMP8Q9BV40 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAMP8Q9BV40 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAMP8Q9BV40 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAMP8Q9BV40 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAMP8Q9BV40 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAMP8Q9BV40 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAMP8Q9BV40 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
VAMP8Q9BV40 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAMP8Q9BV40 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAMP8Q9BV40 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAMP8Q9BV40 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAMP8Q9BV40 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAMP8Q9BV40 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAMP8Q9BV40 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAMP8Q9BV40 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAMP8Q9BV40 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.4 ms