Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRY0

SLC39A3, Zinc transporter ZIP3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A3Q9BRY0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC39A3Q9BRY0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC39A3Q9BRY0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC39A3Q9BRY0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC39A3Q9BRY0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC39A3Q9BRY0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC39A3Q9BRY0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC39A3Q9BRY0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC39A3Q9BRY0 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC39A3Q9BRY0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC39A3Q9BRY0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC39A3Q9BRY0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC39A3Q9BRY0 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC39A3Q9BRY0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC39A3Q9BRY0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC39A3Q9BRY0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC39A3Q9BRY0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC39A3Q9BRY0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC39A3Q9BRY0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC39A3Q9BRY0 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC39A3Q9BRY0 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC39A3Q9BRY0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC39A3Q9BRY0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC39A3Q9BRY0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC39A3Q9BRY0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC39A3Q9BRY0 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC39A3Q9BRY0 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC39A3Q9BRY0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC39A3Q9BRY0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC39A3Q9BRY0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC39A3Q9BRY0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC39A3Q9BRY0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC39A3Q9BRY0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC39A3Q9BRY0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC39A3Q9BRY0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC39A3Q9BRY0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC39A3Q9BRY0 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC39A3Q9BRY0 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC39A3Q9BRY0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC39A3Q9BRY0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC39A3Q9BRY0 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC39A3Q9BRY0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC39A3Q9BRY0 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC39A3Q9BRY0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC39A3Q9BRY0 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC39A3Q9BRY0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC39A3Q9BRY0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC39A3Q9BRY0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC39A3Q9BRY0 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC39A3Q9BRY0 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC39A3Q9BRY0 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC39A3Q9BRY0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC39A3Q9BRY0 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC39A3Q9BRY0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC39A3Q9BRY0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC39A3Q9BRY0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC39A3Q9BRY0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC39A3Q9BRY0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC39A3Q9BRY0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC39A3Q9BRY0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC39A3Q9BRY0 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC39A3Q9BRY0 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC39A3Q9BRY0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC39A3Q9BRY0 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC39A3Q9BRY0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC39A3Q9BRY0 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC39A3Q9BRY0 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC39A3Q9BRY0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC39A3Q9BRY0 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC39A3Q9BRY0 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC39A3Q9BRY0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC39A3Q9BRY0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC39A3Q9BRY0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC39A3Q9BRY0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC39A3Q9BRY0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC39A3Q9BRY0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC39A3Q9BRY0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC39A3Q9BRY0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC39A3Q9BRY0 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC39A3Q9BRY0 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC39A3Q9BRY0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC39A3Q9BRY0 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC39A3Q9BRY0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC39A3Q9BRY0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC39A3Q9BRY0 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC39A3Q9BRY0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC39A3Q9BRY0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC39A3Q9BRY0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC39A3Q9BRY0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC39A3Q9BRY0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC39A3Q9BRY0 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC39A3Q9BRY0 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC39A3Q9BRY0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC39A3Q9BRY0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC39A3Q9BRY0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC39A3Q9BRY0 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC39A3Q9BRY0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC39A3Q9BRY0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC39A3Q9BRY0 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC39A3Q9BRY0 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms