Protein–RNA interactions for Protein: Q99417

MYCBP, c-Myc-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCBPQ99417 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
MYCBPQ99417 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MYCBPQ99417 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MYCBPQ99417 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MYCBPQ99417 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MYCBPQ99417 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MYCBPQ99417 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MYCBPQ99417 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MYCBPQ99417 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MYCBPQ99417 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MYCBPQ99417 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MYCBPQ99417 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MYCBPQ99417 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MYCBPQ99417 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MYCBPQ99417 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MYCBPQ99417 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
MYCBPQ99417 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MYCBPQ99417 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MYCBPQ99417 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MYCBPQ99417 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MYCBPQ99417 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MYCBPQ99417 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MYCBPQ99417 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MYCBPQ99417 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MYCBPQ99417 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
MYCBPQ99417 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MYCBPQ99417 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MYCBPQ99417 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
MYCBPQ99417 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MYCBPQ99417 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MYCBPQ99417 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MYCBPQ99417 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MYCBPQ99417 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MYCBPQ99417 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MYCBPQ99417 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MYCBPQ99417 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MYCBPQ99417 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MYCBPQ99417 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MYCBPQ99417 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MYCBPQ99417 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MYCBPQ99417 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MYCBPQ99417 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MYCBPQ99417 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MYCBPQ99417 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MYCBPQ99417 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MYCBPQ99417 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MYCBPQ99417 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MYCBPQ99417 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MYCBPQ99417 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MYCBPQ99417 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MYCBPQ99417 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MYCBPQ99417 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MYCBPQ99417 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MYCBPQ99417 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MYCBPQ99417 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MYCBPQ99417 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MYCBPQ99417 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MYCBPQ99417 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MYCBPQ99417 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MYCBPQ99417 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MYCBPQ99417 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MYCBPQ99417 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MYCBPQ99417 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MYCBPQ99417 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MYCBPQ99417 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MYCBPQ99417 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MYCBPQ99417 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MYCBPQ99417 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MYCBPQ99417 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MYCBPQ99417 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MYCBPQ99417 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MYCBPQ99417 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MYCBPQ99417 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MYCBPQ99417 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MYCBPQ99417 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MYCBPQ99417 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MYCBPQ99417 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MYCBPQ99417 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MYCBPQ99417 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MYCBPQ99417 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MYCBPQ99417 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MYCBPQ99417 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MYCBPQ99417 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MYCBPQ99417 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MYCBPQ99417 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MYCBPQ99417 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MYCBPQ99417 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MYCBPQ99417 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MYCBPQ99417 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MYCBPQ99417 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MYCBPQ99417 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MYCBPQ99417 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
MYCBPQ99417 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MYCBPQ99417 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MYCBPQ99417 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MYCBPQ99417 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MYCBPQ99417 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MYCBPQ99417 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
MYCBPQ99417 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
MYCBPQ99417 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms