Protein–RNA interactions for Protein: Q96QZ0

PANX3, Pannexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PANX3Q96QZ0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PANX3Q96QZ0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PANX3Q96QZ0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PANX3Q96QZ0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PANX3Q96QZ0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PANX3Q96QZ0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PANX3Q96QZ0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PANX3Q96QZ0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PANX3Q96QZ0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PANX3Q96QZ0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PANX3Q96QZ0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PANX3Q96QZ0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PANX3Q96QZ0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PANX3Q96QZ0 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PANX3Q96QZ0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PANX3Q96QZ0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PANX3Q96QZ0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PANX3Q96QZ0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PANX3Q96QZ0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PANX3Q96QZ0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PANX3Q96QZ0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PANX3Q96QZ0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PANX3Q96QZ0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PANX3Q96QZ0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PANX3Q96QZ0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PANX3Q96QZ0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PANX3Q96QZ0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PANX3Q96QZ0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PANX3Q96QZ0 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
PANX3Q96QZ0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PANX3Q96QZ0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PANX3Q96QZ0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PANX3Q96QZ0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PANX3Q96QZ0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PANX3Q96QZ0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PANX3Q96QZ0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PANX3Q96QZ0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PANX3Q96QZ0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PANX3Q96QZ0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PANX3Q96QZ0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PANX3Q96QZ0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PANX3Q96QZ0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PANX3Q96QZ0 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PANX3Q96QZ0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PANX3Q96QZ0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PANX3Q96QZ0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PANX3Q96QZ0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PANX3Q96QZ0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PANX3Q96QZ0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PANX3Q96QZ0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PANX3Q96QZ0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PANX3Q96QZ0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PANX3Q96QZ0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PANX3Q96QZ0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PANX3Q96QZ0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PANX3Q96QZ0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PANX3Q96QZ0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PANX3Q96QZ0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PANX3Q96QZ0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PANX3Q96QZ0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PANX3Q96QZ0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PANX3Q96QZ0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PANX3Q96QZ0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PANX3Q96QZ0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PANX3Q96QZ0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PANX3Q96QZ0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PANX3Q96QZ0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PANX3Q96QZ0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PANX3Q96QZ0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PANX3Q96QZ0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PANX3Q96QZ0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PANX3Q96QZ0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PANX3Q96QZ0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PANX3Q96QZ0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PANX3Q96QZ0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PANX3Q96QZ0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PANX3Q96QZ0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PANX3Q96QZ0 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PANX3Q96QZ0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PANX3Q96QZ0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PANX3Q96QZ0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PANX3Q96QZ0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PANX3Q96QZ0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PANX3Q96QZ0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PANX3Q96QZ0 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PANX3Q96QZ0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PANX3Q96QZ0 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PANX3Q96QZ0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PANX3Q96QZ0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PANX3Q96QZ0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PANX3Q96QZ0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PANX3Q96QZ0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PANX3Q96QZ0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PANX3Q96QZ0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PANX3Q96QZ0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PANX3Q96QZ0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PANX3Q96QZ0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PANX3Q96QZ0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PANX3Q96QZ0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PANX3Q96QZ0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms