Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q42

ALS2, Alsin, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2Q96Q42 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ALS2Q96Q42 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
ALS2Q96Q42 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ALS2Q96Q42 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
ALS2Q96Q42 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
ALS2Q96Q42 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
ALS2Q96Q42 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
ALS2Q96Q42 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ALS2Q96Q42 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ALS2Q96Q42 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ALS2Q96Q42 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ALS2Q96Q42 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ALS2Q96Q42 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ALS2Q96Q42 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ALS2Q96Q42 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ALS2Q96Q42 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ALS2Q96Q42 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ALS2Q96Q42 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
ALS2Q96Q42 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ALS2Q96Q42 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ALS2Q96Q42 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
ALS2Q96Q42 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
ALS2Q96Q42 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ALS2Q96Q42 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ALS2Q96Q42 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ALS2Q96Q42 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ALS2Q96Q42 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
ALS2Q96Q42 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ALS2Q96Q42 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
ALS2Q96Q42 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
ALS2Q96Q42 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
ALS2Q96Q42 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
ALS2Q96Q42 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
ALS2Q96Q42 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
ALS2Q96Q42 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
ALS2Q96Q42 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
ALS2Q96Q42 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
ALS2Q96Q42 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
ALS2Q96Q42 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.42
ALS2Q96Q42 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
ALS2Q96Q42 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC30.2■■■□□ 2.42
ALS2Q96Q42 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
ALS2Q96Q42 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
ALS2Q96Q42 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ALS2Q96Q42 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC30.19■■■□□ 2.42
ALS2Q96Q42 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ALS2Q96Q42 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
ALS2Q96Q42 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ALS2Q96Q42 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ALS2Q96Q42 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
ALS2Q96Q42 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
ALS2Q96Q42 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
ALS2Q96Q42 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
ALS2Q96Q42 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
ALS2Q96Q42 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
ALS2Q96Q42 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
ALS2Q96Q42 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC30.17■■■□□ 2.42
ALS2Q96Q42 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
ALS2Q96Q42 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
ALS2Q96Q42 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ALS2Q96Q42 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ALS2Q96Q42 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ALS2Q96Q42 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
ALS2Q96Q42 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ALS2Q96Q42 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
ALS2Q96Q42 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
ALS2Q96Q42 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ALS2Q96Q42 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ALS2Q96Q42 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ALS2Q96Q42 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ALS2Q96Q42 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ALS2Q96Q42 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ALS2Q96Q42 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ALS2Q96Q42 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ALS2Q96Q42 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
ALS2Q96Q42 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ALS2Q96Q42 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ALS2Q96Q42 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ALS2Q96Q42 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ALS2Q96Q42 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ALS2Q96Q42 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
ALS2Q96Q42 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ALS2Q96Q42 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
ALS2Q96Q42 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
ALS2Q96Q42 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ALS2Q96Q42 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
ALS2Q96Q42 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
ALS2Q96Q42 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.41
ALS2Q96Q42 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
ALS2Q96Q42 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ALS2Q96Q42 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ALS2Q96Q42 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ALS2Q96Q42 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ALS2Q96Q42 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ALS2Q96Q42 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
ALS2Q96Q42 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ALS2Q96Q42 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ALS2Q96Q42 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
ALS2Q96Q42 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ALS2Q96Q42 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms