Protein–RNA interactions for Protein: Q96PX6

CCDC85A, Coiled-coil domain-containing protein 85A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85AQ96PX6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CCDC85AQ96PX6 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CCDC85AQ96PX6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC85AQ96PX6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC85AQ96PX6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC85AQ96PX6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC85AQ96PX6 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC85AQ96PX6 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC85AQ96PX6 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC85AQ96PX6 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC85AQ96PX6 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC85AQ96PX6 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC85AQ96PX6 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC85AQ96PX6 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC85AQ96PX6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC85AQ96PX6 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC85AQ96PX6 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC85AQ96PX6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC85AQ96PX6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC85AQ96PX6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC85AQ96PX6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC85AQ96PX6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC85AQ96PX6 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC85AQ96PX6 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC85AQ96PX6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC85AQ96PX6 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC85AQ96PX6 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC85AQ96PX6 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC85AQ96PX6 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC85AQ96PX6 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC85AQ96PX6 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC85AQ96PX6 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC85AQ96PX6 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC85AQ96PX6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC85AQ96PX6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC85AQ96PX6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC85AQ96PX6 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC85AQ96PX6 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC85AQ96PX6 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC85AQ96PX6 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC85AQ96PX6 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC85AQ96PX6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC85AQ96PX6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC85AQ96PX6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC85AQ96PX6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC85AQ96PX6 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC85AQ96PX6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC85AQ96PX6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC85AQ96PX6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC85AQ96PX6 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC85AQ96PX6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC85AQ96PX6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC85AQ96PX6 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC85AQ96PX6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC85AQ96PX6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC85AQ96PX6 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC85AQ96PX6 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC85AQ96PX6 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC85AQ96PX6 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC85AQ96PX6 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC85AQ96PX6 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC85AQ96PX6 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC85AQ96PX6 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC85AQ96PX6 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC85AQ96PX6 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC85AQ96PX6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC85AQ96PX6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC85AQ96PX6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC85AQ96PX6 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC85AQ96PX6 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC85AQ96PX6 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC85AQ96PX6 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC85AQ96PX6 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC85AQ96PX6 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC85AQ96PX6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC85AQ96PX6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC85AQ96PX6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC85AQ96PX6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC85AQ96PX6 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC85AQ96PX6 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC85AQ96PX6 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC85AQ96PX6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC85AQ96PX6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC85AQ96PX6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC85AQ96PX6 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC85AQ96PX6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC85AQ96PX6 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC85AQ96PX6 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC85AQ96PX6 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC85AQ96PX6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC85AQ96PX6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC85AQ96PX6 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC85AQ96PX6 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC85AQ96PX6 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CCDC85AQ96PX6 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CCDC85AQ96PX6 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC85AQ96PX6 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC85AQ96PX6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC85AQ96PX6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC85AQ96PX6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms