Protein–RNA interactions for Protein: Q96NG5

ZNF558, Zinc finger protein 558, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF558Q96NG5 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF558Q96NG5 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF558Q96NG5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF558Q96NG5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF558Q96NG5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF558Q96NG5 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF558Q96NG5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF558Q96NG5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF558Q96NG5 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF558Q96NG5 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF558Q96NG5 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF558Q96NG5 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF558Q96NG5 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF558Q96NG5 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF558Q96NG5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF558Q96NG5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF558Q96NG5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF558Q96NG5 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF558Q96NG5 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF558Q96NG5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF558Q96NG5 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF558Q96NG5 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF558Q96NG5 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF558Q96NG5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF558Q96NG5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF558Q96NG5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF558Q96NG5 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF558Q96NG5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF558Q96NG5 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF558Q96NG5 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF558Q96NG5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF558Q96NG5 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF558Q96NG5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF558Q96NG5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF558Q96NG5 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF558Q96NG5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF558Q96NG5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF558Q96NG5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF558Q96NG5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF558Q96NG5 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF558Q96NG5 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF558Q96NG5 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF558Q96NG5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF558Q96NG5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF558Q96NG5 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF558Q96NG5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF558Q96NG5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF558Q96NG5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF558Q96NG5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF558Q96NG5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF558Q96NG5 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF558Q96NG5 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF558Q96NG5 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF558Q96NG5 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF558Q96NG5 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF558Q96NG5 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF558Q96NG5 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF558Q96NG5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF558Q96NG5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF558Q96NG5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF558Q96NG5 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF558Q96NG5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF558Q96NG5 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF558Q96NG5 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF558Q96NG5 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF558Q96NG5 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF558Q96NG5 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF558Q96NG5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF558Q96NG5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF558Q96NG5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF558Q96NG5 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF558Q96NG5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF558Q96NG5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF558Q96NG5 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF558Q96NG5 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF558Q96NG5 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF558Q96NG5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF558Q96NG5 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF558Q96NG5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF558Q96NG5 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF558Q96NG5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF558Q96NG5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF558Q96NG5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF558Q96NG5 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF558Q96NG5 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF558Q96NG5 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF558Q96NG5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF558Q96NG5 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF558Q96NG5 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF558Q96NG5 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF558Q96NG5 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF558Q96NG5 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF558Q96NG5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF558Q96NG5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF558Q96NG5 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF558Q96NG5 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF558Q96NG5 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF558Q96NG5 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF558Q96NG5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF558Q96NG5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms