Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN7

RPGRIP1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPGRIP1Q96KN7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPGRIP1Q96KN7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPGRIP1Q96KN7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPGRIP1Q96KN7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPGRIP1Q96KN7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPGRIP1Q96KN7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPGRIP1Q96KN7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RPGRIP1Q96KN7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPGRIP1Q96KN7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RPGRIP1Q96KN7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPGRIP1Q96KN7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPGRIP1Q96KN7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPGRIP1Q96KN7 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPGRIP1Q96KN7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPGRIP1Q96KN7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPGRIP1Q96KN7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPGRIP1Q96KN7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RPGRIP1Q96KN7 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPGRIP1Q96KN7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPGRIP1Q96KN7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RPGRIP1Q96KN7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPGRIP1Q96KN7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPGRIP1Q96KN7 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPGRIP1Q96KN7 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RPGRIP1Q96KN7 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPGRIP1Q96KN7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPGRIP1Q96KN7 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPGRIP1Q96KN7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPGRIP1Q96KN7 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPGRIP1Q96KN7 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPGRIP1Q96KN7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPGRIP1Q96KN7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPGRIP1Q96KN7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPGRIP1Q96KN7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RPGRIP1Q96KN7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPGRIP1Q96KN7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPGRIP1Q96KN7 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RPGRIP1Q96KN7 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RPGRIP1Q96KN7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RPGRIP1Q96KN7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPGRIP1Q96KN7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPGRIP1Q96KN7 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPGRIP1Q96KN7 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPGRIP1Q96KN7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPGRIP1Q96KN7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPGRIP1Q96KN7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPGRIP1Q96KN7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPGRIP1Q96KN7 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPGRIP1Q96KN7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPGRIP1Q96KN7 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPGRIP1Q96KN7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPGRIP1Q96KN7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPGRIP1Q96KN7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPGRIP1Q96KN7 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPGRIP1Q96KN7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPGRIP1Q96KN7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPGRIP1Q96KN7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPGRIP1Q96KN7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPGRIP1Q96KN7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RPGRIP1Q96KN7 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RPGRIP1Q96KN7 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPGRIP1Q96KN7 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RPGRIP1Q96KN7 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPGRIP1Q96KN7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPGRIP1Q96KN7 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RPGRIP1Q96KN7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RPGRIP1Q96KN7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RPGRIP1Q96KN7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPGRIP1Q96KN7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPGRIP1Q96KN7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPGRIP1Q96KN7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPGRIP1Q96KN7 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPGRIP1Q96KN7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPGRIP1Q96KN7 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPGRIP1Q96KN7 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPGRIP1Q96KN7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPGRIP1Q96KN7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPGRIP1Q96KN7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPGRIP1Q96KN7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPGRIP1Q96KN7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPGRIP1Q96KN7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPGRIP1Q96KN7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RPGRIP1Q96KN7 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPGRIP1Q96KN7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RPGRIP1Q96KN7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPGRIP1Q96KN7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPGRIP1Q96KN7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPGRIP1Q96KN7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPGRIP1Q96KN7 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPGRIP1Q96KN7 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPGRIP1Q96KN7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPGRIP1Q96KN7 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPGRIP1Q96KN7 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPGRIP1Q96KN7 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPGRIP1Q96KN7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPGRIP1Q96KN7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPGRIP1Q96KN7 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPGRIP1Q96KN7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPGRIP1Q96KN7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPGRIP1Q96KN7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms