Protein–RNA interactions for Protein: Q96FV3

TSPAN17, Tetraspanin-17, humanhuman

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN17Q96FV3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSPAN17Q96FV3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSPAN17Q96FV3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSPAN17Q96FV3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSPAN17Q96FV3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSPAN17Q96FV3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSPAN17Q96FV3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TSPAN17Q96FV3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TSPAN17Q96FV3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSPAN17Q96FV3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSPAN17Q96FV3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSPAN17Q96FV3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSPAN17Q96FV3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSPAN17Q96FV3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSPAN17Q96FV3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSPAN17Q96FV3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSPAN17Q96FV3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSPAN17Q96FV3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSPAN17Q96FV3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSPAN17Q96FV3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSPAN17Q96FV3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSPAN17Q96FV3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSPAN17Q96FV3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSPAN17Q96FV3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSPAN17Q96FV3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSPAN17Q96FV3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSPAN17Q96FV3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSPAN17Q96FV3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSPAN17Q96FV3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSPAN17Q96FV3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSPAN17Q96FV3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSPAN17Q96FV3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSPAN17Q96FV3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSPAN17Q96FV3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSPAN17Q96FV3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSPAN17Q96FV3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TSPAN17Q96FV3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TSPAN17Q96FV3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TSPAN17Q96FV3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TSPAN17Q96FV3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TSPAN17Q96FV3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TSPAN17Q96FV3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TSPAN17Q96FV3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TSPAN17Q96FV3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TSPAN17Q96FV3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TSPAN17Q96FV3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TSPAN17Q96FV3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TSPAN17Q96FV3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TSPAN17Q96FV3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TSPAN17Q96FV3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TSPAN17Q96FV3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TSPAN17Q96FV3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TSPAN17Q96FV3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TSPAN17Q96FV3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TSPAN17Q96FV3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TSPAN17Q96FV3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TSPAN17Q96FV3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TSPAN17Q96FV3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSPAN17Q96FV3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSPAN17Q96FV3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TSPAN17Q96FV3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSPAN17Q96FV3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSPAN17Q96FV3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSPAN17Q96FV3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSPAN17Q96FV3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSPAN17Q96FV3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSPAN17Q96FV3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSPAN17Q96FV3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSPAN17Q96FV3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSPAN17Q96FV3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSPAN17Q96FV3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSPAN17Q96FV3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSPAN17Q96FV3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSPAN17Q96FV3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSPAN17Q96FV3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSPAN17Q96FV3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSPAN17Q96FV3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSPAN17Q96FV3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSPAN17Q96FV3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSPAN17Q96FV3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSPAN17Q96FV3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSPAN17Q96FV3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSPAN17Q96FV3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSPAN17Q96FV3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSPAN17Q96FV3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSPAN17Q96FV3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSPAN17Q96FV3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TSPAN17Q96FV3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSPAN17Q96FV3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSPAN17Q96FV3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSPAN17Q96FV3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSPAN17Q96FV3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSPAN17Q96FV3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSPAN17Q96FV3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TSPAN17Q96FV3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
TSPAN17Q96FV3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TSPAN17Q96FV3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TSPAN17Q96FV3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TSPAN17Q96FV3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TSPAN17Q96FV3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
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