Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM1

PGBD4, PiggyBac transposable element-derived protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD4Q96DM1 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PGBD4Q96DM1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PGBD4Q96DM1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PGBD4Q96DM1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PGBD4Q96DM1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PGBD4Q96DM1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PGBD4Q96DM1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PGBD4Q96DM1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PGBD4Q96DM1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PGBD4Q96DM1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PGBD4Q96DM1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PGBD4Q96DM1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PGBD4Q96DM1 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PGBD4Q96DM1 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PGBD4Q96DM1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PGBD4Q96DM1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PGBD4Q96DM1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PGBD4Q96DM1 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PGBD4Q96DM1 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PGBD4Q96DM1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PGBD4Q96DM1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PGBD4Q96DM1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PGBD4Q96DM1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PGBD4Q96DM1 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PGBD4Q96DM1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PGBD4Q96DM1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PGBD4Q96DM1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PGBD4Q96DM1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PGBD4Q96DM1 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PGBD4Q96DM1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PGBD4Q96DM1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PGBD4Q96DM1 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PGBD4Q96DM1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PGBD4Q96DM1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PGBD4Q96DM1 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PGBD4Q96DM1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PGBD4Q96DM1 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PGBD4Q96DM1 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PGBD4Q96DM1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PGBD4Q96DM1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PGBD4Q96DM1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PGBD4Q96DM1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PGBD4Q96DM1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PGBD4Q96DM1 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PGBD4Q96DM1 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PGBD4Q96DM1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PGBD4Q96DM1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PGBD4Q96DM1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PGBD4Q96DM1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PGBD4Q96DM1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PGBD4Q96DM1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PGBD4Q96DM1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PGBD4Q96DM1 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PGBD4Q96DM1 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PGBD4Q96DM1 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PGBD4Q96DM1 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PGBD4Q96DM1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PGBD4Q96DM1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PGBD4Q96DM1 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PGBD4Q96DM1 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PGBD4Q96DM1 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PGBD4Q96DM1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PGBD4Q96DM1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PGBD4Q96DM1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PGBD4Q96DM1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PGBD4Q96DM1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PGBD4Q96DM1 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PGBD4Q96DM1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PGBD4Q96DM1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PGBD4Q96DM1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PGBD4Q96DM1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PGBD4Q96DM1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PGBD4Q96DM1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PGBD4Q96DM1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PGBD4Q96DM1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PGBD4Q96DM1 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PGBD4Q96DM1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PGBD4Q96DM1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PGBD4Q96DM1 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PGBD4Q96DM1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PGBD4Q96DM1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PGBD4Q96DM1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PGBD4Q96DM1 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PGBD4Q96DM1 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PGBD4Q96DM1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PGBD4Q96DM1 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PGBD4Q96DM1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PGBD4Q96DM1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PGBD4Q96DM1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PGBD4Q96DM1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PGBD4Q96DM1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PGBD4Q96DM1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PGBD4Q96DM1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PGBD4Q96DM1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PGBD4Q96DM1 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PGBD4Q96DM1 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PGBD4Q96DM1 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PGBD4Q96DM1 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PGBD4Q96DM1 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PGBD4Q96DM1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms