Protein–RNA interactions for Protein: Q92908

GATA6, Transcription factor GATA-6, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA6Q92908 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GATA6Q92908 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GATA6Q92908 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GATA6Q92908 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GATA6Q92908 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GATA6Q92908 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GATA6Q92908 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GATA6Q92908 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GATA6Q92908 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GATA6Q92908 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GATA6Q92908 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GATA6Q92908 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GATA6Q92908 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GATA6Q92908 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GATA6Q92908 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GATA6Q92908 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GATA6Q92908 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GATA6Q92908 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GATA6Q92908 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GATA6Q92908 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GATA6Q92908 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GATA6Q92908 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GATA6Q92908 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GATA6Q92908 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
GATA6Q92908 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GATA6Q92908 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GATA6Q92908 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GATA6Q92908 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GATA6Q92908 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GATA6Q92908 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GATA6Q92908 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GATA6Q92908 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GATA6Q92908 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GATA6Q92908 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GATA6Q92908 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GATA6Q92908 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GATA6Q92908 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GATA6Q92908 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GATA6Q92908 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GATA6Q92908 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GATA6Q92908 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GATA6Q92908 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GATA6Q92908 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GATA6Q92908 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GATA6Q92908 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GATA6Q92908 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GATA6Q92908 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GATA6Q92908 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GATA6Q92908 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GATA6Q92908 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GATA6Q92908 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GATA6Q92908 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GATA6Q92908 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GATA6Q92908 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GATA6Q92908 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GATA6Q92908 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GATA6Q92908 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GATA6Q92908 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GATA6Q92908 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GATA6Q92908 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GATA6Q92908 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GATA6Q92908 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GATA6Q92908 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GATA6Q92908 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GATA6Q92908 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GATA6Q92908 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GATA6Q92908 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GATA6Q92908 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GATA6Q92908 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GATA6Q92908 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GATA6Q92908 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GATA6Q92908 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GATA6Q92908 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GATA6Q92908 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GATA6Q92908 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GATA6Q92908 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GATA6Q92908 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GATA6Q92908 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GATA6Q92908 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GATA6Q92908 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GATA6Q92908 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GATA6Q92908 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GATA6Q92908 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GATA6Q92908 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GATA6Q92908 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GATA6Q92908 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GATA6Q92908 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GATA6Q92908 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GATA6Q92908 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GATA6Q92908 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GATA6Q92908 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GATA6Q92908 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GATA6Q92908 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GATA6Q92908 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GATA6Q92908 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GATA6Q92908 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GATA6Q92908 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GATA6Q92908 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GATA6Q92908 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GATA6Q92908 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms