Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFJ8

BHLHE22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE22Q8NFJ8 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BHLHE22Q8NFJ8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BHLHE22Q8NFJ8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BHLHE22Q8NFJ8 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BHLHE22Q8NFJ8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BHLHE22Q8NFJ8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BHLHE22Q8NFJ8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BHLHE22Q8NFJ8 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BHLHE22Q8NFJ8 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BHLHE22Q8NFJ8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BHLHE22Q8NFJ8 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BHLHE22Q8NFJ8 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
BHLHE22Q8NFJ8 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BHLHE22Q8NFJ8 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BHLHE22Q8NFJ8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BHLHE22Q8NFJ8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BHLHE22Q8NFJ8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BHLHE22Q8NFJ8 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BHLHE22Q8NFJ8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BHLHE22Q8NFJ8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BHLHE22Q8NFJ8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BHLHE22Q8NFJ8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BHLHE22Q8NFJ8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BHLHE22Q8NFJ8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BHLHE22Q8NFJ8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BHLHE22Q8NFJ8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BHLHE22Q8NFJ8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
BHLHE22Q8NFJ8 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BHLHE22Q8NFJ8 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BHLHE22Q8NFJ8 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BHLHE22Q8NFJ8 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BHLHE22Q8NFJ8 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
BHLHE22Q8NFJ8 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BHLHE22Q8NFJ8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BHLHE22Q8NFJ8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
BHLHE22Q8NFJ8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BHLHE22Q8NFJ8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BHLHE22Q8NFJ8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BHLHE22Q8NFJ8 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BHLHE22Q8NFJ8 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BHLHE22Q8NFJ8 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BHLHE22Q8NFJ8 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BHLHE22Q8NFJ8 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BHLHE22Q8NFJ8 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BHLHE22Q8NFJ8 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BHLHE22Q8NFJ8 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BHLHE22Q8NFJ8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BHLHE22Q8NFJ8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BHLHE22Q8NFJ8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BHLHE22Q8NFJ8 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BHLHE22Q8NFJ8 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BHLHE22Q8NFJ8 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BHLHE22Q8NFJ8 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BHLHE22Q8NFJ8 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BHLHE22Q8NFJ8 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BHLHE22Q8NFJ8 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BHLHE22Q8NFJ8 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BHLHE22Q8NFJ8 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BHLHE22Q8NFJ8 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BHLHE22Q8NFJ8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BHLHE22Q8NFJ8 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BHLHE22Q8NFJ8 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BHLHE22Q8NFJ8 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BHLHE22Q8NFJ8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BHLHE22Q8NFJ8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
BHLHE22Q8NFJ8 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
BHLHE22Q8NFJ8 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
BHLHE22Q8NFJ8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
BHLHE22Q8NFJ8 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
BHLHE22Q8NFJ8 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BHLHE22Q8NFJ8 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BHLHE22Q8NFJ8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BHLHE22Q8NFJ8 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BHLHE22Q8NFJ8 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BHLHE22Q8NFJ8 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BHLHE22Q8NFJ8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BHLHE22Q8NFJ8 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BHLHE22Q8NFJ8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BHLHE22Q8NFJ8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BHLHE22Q8NFJ8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BHLHE22Q8NFJ8 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BHLHE22Q8NFJ8 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BHLHE22Q8NFJ8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BHLHE22Q8NFJ8 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BHLHE22Q8NFJ8 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BHLHE22Q8NFJ8 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BHLHE22Q8NFJ8 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BHLHE22Q8NFJ8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BHLHE22Q8NFJ8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BHLHE22Q8NFJ8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BHLHE22Q8NFJ8 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BHLHE22Q8NFJ8 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BHLHE22Q8NFJ8 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BHLHE22Q8NFJ8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BHLHE22Q8NFJ8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BHLHE22Q8NFJ8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BHLHE22Q8NFJ8 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BHLHE22Q8NFJ8 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BHLHE22Q8NFJ8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BHLHE22Q8NFJ8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms