Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFH5

NUP35, Nucleoporin NUP53, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP35Q8NFH5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP35Q8NFH5 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP35Q8NFH5 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP35Q8NFH5 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP35Q8NFH5 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP35Q8NFH5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP35Q8NFH5 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP35Q8NFH5 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP35Q8NFH5 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP35Q8NFH5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP35Q8NFH5 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP35Q8NFH5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP35Q8NFH5 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP35Q8NFH5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP35Q8NFH5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP35Q8NFH5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP35Q8NFH5 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP35Q8NFH5 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP35Q8NFH5 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP35Q8NFH5 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP35Q8NFH5 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP35Q8NFH5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP35Q8NFH5 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP35Q8NFH5 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP35Q8NFH5 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP35Q8NFH5 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP35Q8NFH5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP35Q8NFH5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP35Q8NFH5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP35Q8NFH5 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP35Q8NFH5 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP35Q8NFH5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP35Q8NFH5 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP35Q8NFH5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP35Q8NFH5 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP35Q8NFH5 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP35Q8NFH5 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP35Q8NFH5 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUP35Q8NFH5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP35Q8NFH5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP35Q8NFH5 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP35Q8NFH5 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP35Q8NFH5 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP35Q8NFH5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP35Q8NFH5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP35Q8NFH5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP35Q8NFH5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP35Q8NFH5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP35Q8NFH5 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP35Q8NFH5 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP35Q8NFH5 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP35Q8NFH5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP35Q8NFH5 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUP35Q8NFH5 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NUP35Q8NFH5 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NUP35Q8NFH5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NUP35Q8NFH5 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NUP35Q8NFH5 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NUP35Q8NFH5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NUP35Q8NFH5 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NUP35Q8NFH5 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NUP35Q8NFH5 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NUP35Q8NFH5 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NUP35Q8NFH5 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NUP35Q8NFH5 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NUP35Q8NFH5 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NUP35Q8NFH5 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NUP35Q8NFH5 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP35Q8NFH5 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP35Q8NFH5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP35Q8NFH5 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP35Q8NFH5 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP35Q8NFH5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP35Q8NFH5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP35Q8NFH5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP35Q8NFH5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP35Q8NFH5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP35Q8NFH5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP35Q8NFH5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP35Q8NFH5 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP35Q8NFH5 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP35Q8NFH5 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP35Q8NFH5 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP35Q8NFH5 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP35Q8NFH5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP35Q8NFH5 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP35Q8NFH5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP35Q8NFH5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP35Q8NFH5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP35Q8NFH5 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP35Q8NFH5 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP35Q8NFH5 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP35Q8NFH5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP35Q8NFH5 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP35Q8NFH5 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP35Q8NFH5 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP35Q8NFH5 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP35Q8NFH5 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP35Q8NFH5 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP35Q8NFH5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms