Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA58

PNLDC1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNLDC1Q8NA58 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PNLDC1Q8NA58 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PNLDC1Q8NA58 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PNLDC1Q8NA58 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PNLDC1Q8NA58 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PNLDC1Q8NA58 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PNLDC1Q8NA58 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PNLDC1Q8NA58 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PNLDC1Q8NA58 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PNLDC1Q8NA58 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PNLDC1Q8NA58 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PNLDC1Q8NA58 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PNLDC1Q8NA58 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PNLDC1Q8NA58 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PNLDC1Q8NA58 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PNLDC1Q8NA58 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PNLDC1Q8NA58 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PNLDC1Q8NA58 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PNLDC1Q8NA58 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PNLDC1Q8NA58 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PNLDC1Q8NA58 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PNLDC1Q8NA58 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PNLDC1Q8NA58 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PNLDC1Q8NA58 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PNLDC1Q8NA58 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PNLDC1Q8NA58 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PNLDC1Q8NA58 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PNLDC1Q8NA58 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PNLDC1Q8NA58 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PNLDC1Q8NA58 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PNLDC1Q8NA58 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PNLDC1Q8NA58 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PNLDC1Q8NA58 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PNLDC1Q8NA58 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PNLDC1Q8NA58 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PNLDC1Q8NA58 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PNLDC1Q8NA58 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PNLDC1Q8NA58 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PNLDC1Q8NA58 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PNLDC1Q8NA58 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PNLDC1Q8NA58 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PNLDC1Q8NA58 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PNLDC1Q8NA58 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PNLDC1Q8NA58 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PNLDC1Q8NA58 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PNLDC1Q8NA58 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PNLDC1Q8NA58 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PNLDC1Q8NA58 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PNLDC1Q8NA58 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PNLDC1Q8NA58 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PNLDC1Q8NA58 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PNLDC1Q8NA58 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PNLDC1Q8NA58 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PNLDC1Q8NA58 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PNLDC1Q8NA58 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PNLDC1Q8NA58 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PNLDC1Q8NA58 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PNLDC1Q8NA58 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PNLDC1Q8NA58 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PNLDC1Q8NA58 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PNLDC1Q8NA58 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PNLDC1Q8NA58 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PNLDC1Q8NA58 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PNLDC1Q8NA58 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PNLDC1Q8NA58 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PNLDC1Q8NA58 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PNLDC1Q8NA58 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PNLDC1Q8NA58 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PNLDC1Q8NA58 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PNLDC1Q8NA58 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PNLDC1Q8NA58 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PNLDC1Q8NA58 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PNLDC1Q8NA58 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PNLDC1Q8NA58 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PNLDC1Q8NA58 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PNLDC1Q8NA58 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PNLDC1Q8NA58 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PNLDC1Q8NA58 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PNLDC1Q8NA58 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PNLDC1Q8NA58 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PNLDC1Q8NA58 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PNLDC1Q8NA58 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PNLDC1Q8NA58 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PNLDC1Q8NA58 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PNLDC1Q8NA58 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PNLDC1Q8NA58 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PNLDC1Q8NA58 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PNLDC1Q8NA58 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PNLDC1Q8NA58 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PNLDC1Q8NA58 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PNLDC1Q8NA58 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PNLDC1Q8NA58 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PNLDC1Q8NA58 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PNLDC1Q8NA58 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PNLDC1Q8NA58 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PNLDC1Q8NA58 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PNLDC1Q8NA58 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PNLDC1Q8NA58 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PNLDC1Q8NA58 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PNLDC1Q8NA58 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms