Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5R6

CCDC33, Coiled-coil domain-containing protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC33Q8N5R6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC33Q8N5R6 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC33Q8N5R6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC33Q8N5R6 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC33Q8N5R6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC33Q8N5R6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC33Q8N5R6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC33Q8N5R6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC33Q8N5R6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC33Q8N5R6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC33Q8N5R6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC33Q8N5R6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC33Q8N5R6 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC33Q8N5R6 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC33Q8N5R6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC33Q8N5R6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC33Q8N5R6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC33Q8N5R6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC33Q8N5R6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC33Q8N5R6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC33Q8N5R6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC33Q8N5R6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC33Q8N5R6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC33Q8N5R6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC33Q8N5R6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC33Q8N5R6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC33Q8N5R6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC33Q8N5R6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC33Q8N5R6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC33Q8N5R6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC33Q8N5R6 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC33Q8N5R6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC33Q8N5R6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC33Q8N5R6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC33Q8N5R6 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC33Q8N5R6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC33Q8N5R6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC33Q8N5R6 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC33Q8N5R6 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC33Q8N5R6 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC33Q8N5R6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC33Q8N5R6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC33Q8N5R6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC33Q8N5R6 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC33Q8N5R6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC33Q8N5R6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC33Q8N5R6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC33Q8N5R6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC33Q8N5R6 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC33Q8N5R6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC33Q8N5R6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC33Q8N5R6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC33Q8N5R6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC33Q8N5R6 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC33Q8N5R6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC33Q8N5R6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC33Q8N5R6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC33Q8N5R6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC33Q8N5R6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC33Q8N5R6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC33Q8N5R6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC33Q8N5R6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC33Q8N5R6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC33Q8N5R6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC33Q8N5R6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC33Q8N5R6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC33Q8N5R6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC33Q8N5R6 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC33Q8N5R6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC33Q8N5R6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC33Q8N5R6 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC33Q8N5R6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC33Q8N5R6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC33Q8N5R6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC33Q8N5R6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC33Q8N5R6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC33Q8N5R6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC33Q8N5R6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC33Q8N5R6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC33Q8N5R6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC33Q8N5R6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC33Q8N5R6 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC33Q8N5R6 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC33Q8N5R6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC33Q8N5R6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC33Q8N5R6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC33Q8N5R6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC33Q8N5R6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC33Q8N5R6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC33Q8N5R6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC33Q8N5R6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC33Q8N5R6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC33Q8N5R6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC33Q8N5R6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC33Q8N5R6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC33Q8N5R6 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC33Q8N5R6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC33Q8N5R6 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC33Q8N5R6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC33Q8N5R6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms