Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZ73

RPUSD2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD2Q8IZ73 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPUSD2Q8IZ73 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPUSD2Q8IZ73 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RPUSD2Q8IZ73 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPUSD2Q8IZ73 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPUSD2Q8IZ73 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPUSD2Q8IZ73 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPUSD2Q8IZ73 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPUSD2Q8IZ73 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPUSD2Q8IZ73 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPUSD2Q8IZ73 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPUSD2Q8IZ73 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPUSD2Q8IZ73 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RPUSD2Q8IZ73 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPUSD2Q8IZ73 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RPUSD2Q8IZ73 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RPUSD2Q8IZ73 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPUSD2Q8IZ73 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPUSD2Q8IZ73 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPUSD2Q8IZ73 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPUSD2Q8IZ73 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPUSD2Q8IZ73 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPUSD2Q8IZ73 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPUSD2Q8IZ73 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPUSD2Q8IZ73 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPUSD2Q8IZ73 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPUSD2Q8IZ73 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPUSD2Q8IZ73 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPUSD2Q8IZ73 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPUSD2Q8IZ73 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPUSD2Q8IZ73 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPUSD2Q8IZ73 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPUSD2Q8IZ73 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPUSD2Q8IZ73 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPUSD2Q8IZ73 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPUSD2Q8IZ73 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPUSD2Q8IZ73 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPUSD2Q8IZ73 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPUSD2Q8IZ73 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPUSD2Q8IZ73 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPUSD2Q8IZ73 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPUSD2Q8IZ73 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPUSD2Q8IZ73 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPUSD2Q8IZ73 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPUSD2Q8IZ73 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPUSD2Q8IZ73 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPUSD2Q8IZ73 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPUSD2Q8IZ73 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPUSD2Q8IZ73 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPUSD2Q8IZ73 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPUSD2Q8IZ73 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPUSD2Q8IZ73 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPUSD2Q8IZ73 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPUSD2Q8IZ73 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPUSD2Q8IZ73 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPUSD2Q8IZ73 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RPUSD2Q8IZ73 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPUSD2Q8IZ73 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPUSD2Q8IZ73 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPUSD2Q8IZ73 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPUSD2Q8IZ73 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RPUSD2Q8IZ73 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPUSD2Q8IZ73 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPUSD2Q8IZ73 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPUSD2Q8IZ73 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPUSD2Q8IZ73 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPUSD2Q8IZ73 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPUSD2Q8IZ73 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPUSD2Q8IZ73 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPUSD2Q8IZ73 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPUSD2Q8IZ73 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPUSD2Q8IZ73 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPUSD2Q8IZ73 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPUSD2Q8IZ73 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPUSD2Q8IZ73 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPUSD2Q8IZ73 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPUSD2Q8IZ73 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPUSD2Q8IZ73 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPUSD2Q8IZ73 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPUSD2Q8IZ73 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RPUSD2Q8IZ73 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPUSD2Q8IZ73 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPUSD2Q8IZ73 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPUSD2Q8IZ73 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPUSD2Q8IZ73 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPUSD2Q8IZ73 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPUSD2Q8IZ73 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPUSD2Q8IZ73 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPUSD2Q8IZ73 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPUSD2Q8IZ73 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPUSD2Q8IZ73 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPUSD2Q8IZ73 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPUSD2Q8IZ73 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPUSD2Q8IZ73 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPUSD2Q8IZ73 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPUSD2Q8IZ73 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPUSD2Q8IZ73 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPUSD2Q8IZ73 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPUSD2Q8IZ73 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPUSD2Q8IZ73 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms