Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXV7

KLHDC8B, Kelch domain-containing protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC8BQ8IXV7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHDC8BQ8IXV7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHDC8BQ8IXV7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHDC8BQ8IXV7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHDC8BQ8IXV7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHDC8BQ8IXV7 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHDC8BQ8IXV7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHDC8BQ8IXV7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHDC8BQ8IXV7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHDC8BQ8IXV7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHDC8BQ8IXV7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHDC8BQ8IXV7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHDC8BQ8IXV7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHDC8BQ8IXV7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHDC8BQ8IXV7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHDC8BQ8IXV7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHDC8BQ8IXV7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHDC8BQ8IXV7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHDC8BQ8IXV7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHDC8BQ8IXV7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHDC8BQ8IXV7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHDC8BQ8IXV7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHDC8BQ8IXV7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHDC8BQ8IXV7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHDC8BQ8IXV7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHDC8BQ8IXV7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHDC8BQ8IXV7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHDC8BQ8IXV7 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHDC8BQ8IXV7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHDC8BQ8IXV7 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHDC8BQ8IXV7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHDC8BQ8IXV7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHDC8BQ8IXV7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHDC8BQ8IXV7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHDC8BQ8IXV7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHDC8BQ8IXV7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHDC8BQ8IXV7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHDC8BQ8IXV7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHDC8BQ8IXV7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHDC8BQ8IXV7 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHDC8BQ8IXV7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHDC8BQ8IXV7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHDC8BQ8IXV7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHDC8BQ8IXV7 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHDC8BQ8IXV7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHDC8BQ8IXV7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHDC8BQ8IXV7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHDC8BQ8IXV7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHDC8BQ8IXV7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHDC8BQ8IXV7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KLHDC8BQ8IXV7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KLHDC8BQ8IXV7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHDC8BQ8IXV7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHDC8BQ8IXV7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHDC8BQ8IXV7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHDC8BQ8IXV7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHDC8BQ8IXV7 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHDC8BQ8IXV7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHDC8BQ8IXV7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHDC8BQ8IXV7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHDC8BQ8IXV7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHDC8BQ8IXV7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHDC8BQ8IXV7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHDC8BQ8IXV7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHDC8BQ8IXV7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHDC8BQ8IXV7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHDC8BQ8IXV7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHDC8BQ8IXV7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHDC8BQ8IXV7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHDC8BQ8IXV7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHDC8BQ8IXV7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHDC8BQ8IXV7 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHDC8BQ8IXV7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHDC8BQ8IXV7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHDC8BQ8IXV7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHDC8BQ8IXV7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHDC8BQ8IXV7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHDC8BQ8IXV7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHDC8BQ8IXV7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHDC8BQ8IXV7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHDC8BQ8IXV7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHDC8BQ8IXV7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHDC8BQ8IXV7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHDC8BQ8IXV7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHDC8BQ8IXV7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHDC8BQ8IXV7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHDC8BQ8IXV7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHDC8BQ8IXV7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHDC8BQ8IXV7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHDC8BQ8IXV7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHDC8BQ8IXV7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHDC8BQ8IXV7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHDC8BQ8IXV7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHDC8BQ8IXV7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHDC8BQ8IXV7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHDC8BQ8IXV7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHDC8BQ8IXV7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHDC8BQ8IXV7 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHDC8BQ8IXV7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHDC8BQ8IXV7 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.7 ms