Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVG5

SAMD9L, Sterile alpha motif domain-containing protein 9-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD9LQ8IVG5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SAMD9LQ8IVG5 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
SAMD9LQ8IVG5 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SAMD9LQ8IVG5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SAMD9LQ8IVG5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SAMD9LQ8IVG5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
SAMD9LQ8IVG5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
SAMD9LQ8IVG5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SAMD9LQ8IVG5 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
SAMD9LQ8IVG5 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
SAMD9LQ8IVG5 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SAMD9LQ8IVG5 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
SAMD9LQ8IVG5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
SAMD9LQ8IVG5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SAMD9LQ8IVG5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SAMD9LQ8IVG5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
SAMD9LQ8IVG5 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
SAMD9LQ8IVG5 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
SAMD9LQ8IVG5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SAMD9LQ8IVG5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SAMD9LQ8IVG5 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SAMD9LQ8IVG5 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SAMD9LQ8IVG5 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SAMD9LQ8IVG5 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
SAMD9LQ8IVG5 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
SAMD9LQ8IVG5 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
SAMD9LQ8IVG5 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
SAMD9LQ8IVG5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
SAMD9LQ8IVG5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
SAMD9LQ8IVG5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
SAMD9LQ8IVG5 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
SAMD9LQ8IVG5 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
SAMD9LQ8IVG5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
SAMD9LQ8IVG5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
SAMD9LQ8IVG5 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
SAMD9LQ8IVG5 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
SAMD9LQ8IVG5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
SAMD9LQ8IVG5 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
SAMD9LQ8IVG5 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
SAMD9LQ8IVG5 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
SAMD9LQ8IVG5 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC33.82■■■■□ 3
SAMD9LQ8IVG5 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
SAMD9LQ8IVG5 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
SAMD9LQ8IVG5 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC33.82■■■■□ 3
SAMD9LQ8IVG5 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
SAMD9LQ8IVG5 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
SAMD9LQ8IVG5 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
SAMD9LQ8IVG5 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
SAMD9LQ8IVG5 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC33.81■■■■□ 3
SAMD9LQ8IVG5 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC33.81■■■■□ 3
SAMD9LQ8IVG5 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC33.81■■■■□ 3
SAMD9LQ8IVG5 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
SAMD9LQ8IVG5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SAMD9LQ8IVG5 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
SAMD9LQ8IVG5 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SAMD9LQ8IVG5 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC33.8■■■■□ 3
SAMD9LQ8IVG5 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
SAMD9LQ8IVG5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SAMD9LQ8IVG5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
SAMD9LQ8IVG5 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
SAMD9LQ8IVG5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SAMD9LQ8IVG5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
SAMD9LQ8IVG5 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
SAMD9LQ8IVG5 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC33.78■■■■□ 3
SAMD9LQ8IVG5 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
SAMD9LQ8IVG5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
SAMD9LQ8IVG5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
SAMD9LQ8IVG5 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
SAMD9LQ8IVG5 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
SAMD9LQ8IVG5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
SAMD9LQ8IVG5 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC33.77■■■■□ 3
SAMD9LQ8IVG5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
SAMD9LQ8IVG5 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
SAMD9LQ8IVG5 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
SAMD9LQ8IVG5 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
SAMD9LQ8IVG5 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
SAMD9LQ8IVG5 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
SAMD9LQ8IVG5 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
SAMD9LQ8IVG5 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
SAMD9LQ8IVG5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
SAMD9LQ8IVG5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
SAMD9LQ8IVG5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
SAMD9LQ8IVG5 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
SAMD9LQ8IVG5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
SAMD9LQ8IVG5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
SAMD9LQ8IVG5 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
SAMD9LQ8IVG5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
SAMD9LQ8IVG5 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
SAMD9LQ8IVG5 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
SAMD9LQ8IVG5 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
SAMD9LQ8IVG5 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
SAMD9LQ8IVG5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
SAMD9LQ8IVG5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
SAMD9LQ8IVG5 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
SAMD9LQ8IVG5 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
SAMD9LQ8IVG5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
SAMD9LQ8IVG5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
SAMD9LQ8IVG5 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
SAMD9LQ8IVG5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
SAMD9LQ8IVG5 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms