Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV77

CNGA4, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA4Q8IV77 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNGA4Q8IV77 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNGA4Q8IV77 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNGA4Q8IV77 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNGA4Q8IV77 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNGA4Q8IV77 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNGA4Q8IV77 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNGA4Q8IV77 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNGA4Q8IV77 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNGA4Q8IV77 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNGA4Q8IV77 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNGA4Q8IV77 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNGA4Q8IV77 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNGA4Q8IV77 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNGA4Q8IV77 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNGA4Q8IV77 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNGA4Q8IV77 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNGA4Q8IV77 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNGA4Q8IV77 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNGA4Q8IV77 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNGA4Q8IV77 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNGA4Q8IV77 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNGA4Q8IV77 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CNGA4Q8IV77 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNGA4Q8IV77 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNGA4Q8IV77 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNGA4Q8IV77 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNGA4Q8IV77 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNGA4Q8IV77 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNGA4Q8IV77 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNGA4Q8IV77 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNGA4Q8IV77 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNGA4Q8IV77 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNGA4Q8IV77 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNGA4Q8IV77 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNGA4Q8IV77 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CNGA4Q8IV77 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNGA4Q8IV77 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNGA4Q8IV77 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNGA4Q8IV77 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNGA4Q8IV77 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNGA4Q8IV77 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNGA4Q8IV77 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNGA4Q8IV77 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNGA4Q8IV77 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNGA4Q8IV77 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNGA4Q8IV77 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNGA4Q8IV77 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNGA4Q8IV77 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNGA4Q8IV77 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNGA4Q8IV77 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNGA4Q8IV77 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNGA4Q8IV77 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNGA4Q8IV77 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNGA4Q8IV77 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNGA4Q8IV77 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNGA4Q8IV77 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CNGA4Q8IV77 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNGA4Q8IV77 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
CNGA4Q8IV77 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
CNGA4Q8IV77 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNGA4Q8IV77 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNGA4Q8IV77 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNGA4Q8IV77 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNGA4Q8IV77 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNGA4Q8IV77 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNGA4Q8IV77 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CNGA4Q8IV77 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNGA4Q8IV77 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNGA4Q8IV77 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNGA4Q8IV77 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNGA4Q8IV77 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNGA4Q8IV77 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNGA4Q8IV77 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNGA4Q8IV77 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CNGA4Q8IV77 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CNGA4Q8IV77 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNGA4Q8IV77 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNGA4Q8IV77 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CNGA4Q8IV77 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNGA4Q8IV77 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNGA4Q8IV77 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNGA4Q8IV77 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNGA4Q8IV77 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNGA4Q8IV77 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CNGA4Q8IV77 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNGA4Q8IV77 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNGA4Q8IV77 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNGA4Q8IV77 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNGA4Q8IV77 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNGA4Q8IV77 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNGA4Q8IV77 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNGA4Q8IV77 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNGA4Q8IV77 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNGA4Q8IV77 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNGA4Q8IV77 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNGA4Q8IV77 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNGA4Q8IV77 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNGA4Q8IV77 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNGA4Q8IV77 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms