Protein–RNA interactions for Protein: Q7LGA3

HS2ST1, Heparan sulfate 2-O-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS2ST1Q7LGA3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HS2ST1Q7LGA3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HS2ST1Q7LGA3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HS2ST1Q7LGA3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
HS2ST1Q7LGA3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HS2ST1Q7LGA3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HS2ST1Q7LGA3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HS2ST1Q7LGA3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
HS2ST1Q7LGA3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
HS2ST1Q7LGA3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HS2ST1Q7LGA3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HS2ST1Q7LGA3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HS2ST1Q7LGA3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HS2ST1Q7LGA3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HS2ST1Q7LGA3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HS2ST1Q7LGA3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HS2ST1Q7LGA3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HS2ST1Q7LGA3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HS2ST1Q7LGA3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HS2ST1Q7LGA3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HS2ST1Q7LGA3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
HS2ST1Q7LGA3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HS2ST1Q7LGA3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HS2ST1Q7LGA3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HS2ST1Q7LGA3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HS2ST1Q7LGA3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HS2ST1Q7LGA3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HS2ST1Q7LGA3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HS2ST1Q7LGA3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HS2ST1Q7LGA3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HS2ST1Q7LGA3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HS2ST1Q7LGA3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HS2ST1Q7LGA3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HS2ST1Q7LGA3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HS2ST1Q7LGA3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HS2ST1Q7LGA3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HS2ST1Q7LGA3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HS2ST1Q7LGA3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
HS2ST1Q7LGA3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HS2ST1Q7LGA3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HS2ST1Q7LGA3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
HS2ST1Q7LGA3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HS2ST1Q7LGA3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HS2ST1Q7LGA3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HS2ST1Q7LGA3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HS2ST1Q7LGA3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HS2ST1Q7LGA3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HS2ST1Q7LGA3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HS2ST1Q7LGA3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HS2ST1Q7LGA3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HS2ST1Q7LGA3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HS2ST1Q7LGA3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HS2ST1Q7LGA3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HS2ST1Q7LGA3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HS2ST1Q7LGA3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HS2ST1Q7LGA3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HS2ST1Q7LGA3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HS2ST1Q7LGA3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HS2ST1Q7LGA3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HS2ST1Q7LGA3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HS2ST1Q7LGA3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HS2ST1Q7LGA3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HS2ST1Q7LGA3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HS2ST1Q7LGA3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HS2ST1Q7LGA3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HS2ST1Q7LGA3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HS2ST1Q7LGA3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
HS2ST1Q7LGA3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HS2ST1Q7LGA3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HS2ST1Q7LGA3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HS2ST1Q7LGA3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HS2ST1Q7LGA3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HS2ST1Q7LGA3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HS2ST1Q7LGA3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HS2ST1Q7LGA3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HS2ST1Q7LGA3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
HS2ST1Q7LGA3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
HS2ST1Q7LGA3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HS2ST1Q7LGA3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HS2ST1Q7LGA3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HS2ST1Q7LGA3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HS2ST1Q7LGA3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HS2ST1Q7LGA3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HS2ST1Q7LGA3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HS2ST1Q7LGA3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HS2ST1Q7LGA3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HS2ST1Q7LGA3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HS2ST1Q7LGA3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HS2ST1Q7LGA3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HS2ST1Q7LGA3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HS2ST1Q7LGA3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HS2ST1Q7LGA3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HS2ST1Q7LGA3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HS2ST1Q7LGA3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HS2ST1Q7LGA3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HS2ST1Q7LGA3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HS2ST1Q7LGA3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HS2ST1Q7LGA3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HS2ST1Q7LGA3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HS2ST1Q7LGA3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms