Protein–RNA interactions for Protein: Q7L5N7

LPCAT2, Lysophosphatidylcholine acyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPCAT2Q7L5N7 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LPCAT2Q7L5N7 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LPCAT2Q7L5N7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LPCAT2Q7L5N7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LPCAT2Q7L5N7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LPCAT2Q7L5N7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LPCAT2Q7L5N7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LPCAT2Q7L5N7 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LPCAT2Q7L5N7 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
LPCAT2Q7L5N7 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LPCAT2Q7L5N7 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LPCAT2Q7L5N7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LPCAT2Q7L5N7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LPCAT2Q7L5N7 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LPCAT2Q7L5N7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LPCAT2Q7L5N7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LPCAT2Q7L5N7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LPCAT2Q7L5N7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LPCAT2Q7L5N7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LPCAT2Q7L5N7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LPCAT2Q7L5N7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LPCAT2Q7L5N7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LPCAT2Q7L5N7 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LPCAT2Q7L5N7 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LPCAT2Q7L5N7 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LPCAT2Q7L5N7 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LPCAT2Q7L5N7 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LPCAT2Q7L5N7 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LPCAT2Q7L5N7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LPCAT2Q7L5N7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LPCAT2Q7L5N7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LPCAT2Q7L5N7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LPCAT2Q7L5N7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LPCAT2Q7L5N7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LPCAT2Q7L5N7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LPCAT2Q7L5N7 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LPCAT2Q7L5N7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LPCAT2Q7L5N7 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LPCAT2Q7L5N7 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LPCAT2Q7L5N7 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LPCAT2Q7L5N7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LPCAT2Q7L5N7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LPCAT2Q7L5N7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LPCAT2Q7L5N7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LPCAT2Q7L5N7 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LPCAT2Q7L5N7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LPCAT2Q7L5N7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LPCAT2Q7L5N7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LPCAT2Q7L5N7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LPCAT2Q7L5N7 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LPCAT2Q7L5N7 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LPCAT2Q7L5N7 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LPCAT2Q7L5N7 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LPCAT2Q7L5N7 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LPCAT2Q7L5N7 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LPCAT2Q7L5N7 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LPCAT2Q7L5N7 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LPCAT2Q7L5N7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LPCAT2Q7L5N7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LPCAT2Q7L5N7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LPCAT2Q7L5N7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LPCAT2Q7L5N7 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LPCAT2Q7L5N7 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LPCAT2Q7L5N7 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LPCAT2Q7L5N7 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LPCAT2Q7L5N7 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LPCAT2Q7L5N7 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LPCAT2Q7L5N7 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LPCAT2Q7L5N7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LPCAT2Q7L5N7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LPCAT2Q7L5N7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LPCAT2Q7L5N7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LPCAT2Q7L5N7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LPCAT2Q7L5N7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LPCAT2Q7L5N7 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LPCAT2Q7L5N7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LPCAT2Q7L5N7 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LPCAT2Q7L5N7 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LPCAT2Q7L5N7 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LPCAT2Q7L5N7 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LPCAT2Q7L5N7 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LPCAT2Q7L5N7 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LPCAT2Q7L5N7 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LPCAT2Q7L5N7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LPCAT2Q7L5N7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LPCAT2Q7L5N7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LPCAT2Q7L5N7 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LPCAT2Q7L5N7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LPCAT2Q7L5N7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LPCAT2Q7L5N7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LPCAT2Q7L5N7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LPCAT2Q7L5N7 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LPCAT2Q7L5N7 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LPCAT2Q7L5N7 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LPCAT2Q7L5N7 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LPCAT2Q7L5N7 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LPCAT2Q7L5N7 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LPCAT2Q7L5N7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LPCAT2Q7L5N7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LPCAT2Q7L5N7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms