Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC9

SMIM5, Small integral membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM5Q71RC9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SMIM5Q71RC9 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SMIM5Q71RC9 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SMIM5Q71RC9 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SMIM5Q71RC9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SMIM5Q71RC9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SMIM5Q71RC9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SMIM5Q71RC9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SMIM5Q71RC9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SMIM5Q71RC9 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SMIM5Q71RC9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SMIM5Q71RC9 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SMIM5Q71RC9 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SMIM5Q71RC9 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SMIM5Q71RC9 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SMIM5Q71RC9 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SMIM5Q71RC9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SMIM5Q71RC9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SMIM5Q71RC9 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SMIM5Q71RC9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SMIM5Q71RC9 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SMIM5Q71RC9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SMIM5Q71RC9 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
SMIM5Q71RC9 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SMIM5Q71RC9 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
SMIM5Q71RC9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SMIM5Q71RC9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SMIM5Q71RC9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SMIM5Q71RC9 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SMIM5Q71RC9 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SMIM5Q71RC9 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SMIM5Q71RC9 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SMIM5Q71RC9 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SMIM5Q71RC9 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SMIM5Q71RC9 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
SMIM5Q71RC9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SMIM5Q71RC9 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SMIM5Q71RC9 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SMIM5Q71RC9 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
SMIM5Q71RC9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SMIM5Q71RC9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SMIM5Q71RC9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SMIM5Q71RC9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SMIM5Q71RC9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
SMIM5Q71RC9 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SMIM5Q71RC9 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SMIM5Q71RC9 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
SMIM5Q71RC9 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SMIM5Q71RC9 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SMIM5Q71RC9 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SMIM5Q71RC9 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SMIM5Q71RC9 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SMIM5Q71RC9 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SMIM5Q71RC9 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SMIM5Q71RC9 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
SMIM5Q71RC9 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SMIM5Q71RC9 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SMIM5Q71RC9 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SMIM5Q71RC9 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SMIM5Q71RC9 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SMIM5Q71RC9 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SMIM5Q71RC9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SMIM5Q71RC9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SMIM5Q71RC9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SMIM5Q71RC9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SMIM5Q71RC9 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SMIM5Q71RC9 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SMIM5Q71RC9 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SMIM5Q71RC9 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SMIM5Q71RC9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SMIM5Q71RC9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SMIM5Q71RC9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SMIM5Q71RC9 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SMIM5Q71RC9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SMIM5Q71RC9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SMIM5Q71RC9 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SMIM5Q71RC9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
SMIM5Q71RC9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SMIM5Q71RC9 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SMIM5Q71RC9 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SMIM5Q71RC9 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SMIM5Q71RC9 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SMIM5Q71RC9 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SMIM5Q71RC9 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SMIM5Q71RC9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SMIM5Q71RC9 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SMIM5Q71RC9 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SMIM5Q71RC9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SMIM5Q71RC9 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SMIM5Q71RC9 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SMIM5Q71RC9 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SMIM5Q71RC9 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SMIM5Q71RC9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SMIM5Q71RC9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SMIM5Q71RC9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SMIM5Q71RC9 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SMIM5Q71RC9 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SMIM5Q71RC9 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SMIM5Q71RC9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SMIM5Q71RC9 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms