Protein–RNA interactions for Protein: Q717R9

CYS1, Cystin-1, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYS1Q717R9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CYS1Q717R9 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CYS1Q717R9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYS1Q717R9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYS1Q717R9 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYS1Q717R9 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYS1Q717R9 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYS1Q717R9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYS1Q717R9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYS1Q717R9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYS1Q717R9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CYS1Q717R9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYS1Q717R9 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYS1Q717R9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYS1Q717R9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYS1Q717R9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYS1Q717R9 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYS1Q717R9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYS1Q717R9 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYS1Q717R9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYS1Q717R9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYS1Q717R9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYS1Q717R9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYS1Q717R9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYS1Q717R9 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYS1Q717R9 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYS1Q717R9 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYS1Q717R9 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYS1Q717R9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYS1Q717R9 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYS1Q717R9 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYS1Q717R9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYS1Q717R9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYS1Q717R9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CYS1Q717R9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYS1Q717R9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYS1Q717R9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYS1Q717R9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYS1Q717R9 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYS1Q717R9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYS1Q717R9 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYS1Q717R9 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYS1Q717R9 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYS1Q717R9 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYS1Q717R9 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYS1Q717R9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CYS1Q717R9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYS1Q717R9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYS1Q717R9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYS1Q717R9 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYS1Q717R9 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYS1Q717R9 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYS1Q717R9 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYS1Q717R9 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYS1Q717R9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYS1Q717R9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYS1Q717R9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYS1Q717R9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYS1Q717R9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYS1Q717R9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYS1Q717R9 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYS1Q717R9 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CYS1Q717R9 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CYS1Q717R9 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CYS1Q717R9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CYS1Q717R9 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CYS1Q717R9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CYS1Q717R9 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYS1Q717R9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYS1Q717R9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYS1Q717R9 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYS1Q717R9 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYS1Q717R9 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYS1Q717R9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYS1Q717R9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYS1Q717R9 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYS1Q717R9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYS1Q717R9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CYS1Q717R9 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYS1Q717R9 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYS1Q717R9 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYS1Q717R9 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYS1Q717R9 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYS1Q717R9 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYS1Q717R9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYS1Q717R9 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYS1Q717R9 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYS1Q717R9 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYS1Q717R9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYS1Q717R9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYS1Q717R9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYS1Q717R9 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYS1Q717R9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYS1Q717R9 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYS1Q717R9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYS1Q717R9 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYS1Q717R9 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYS1Q717R9 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYS1Q717R9 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYS1Q717R9 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms