Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXC1

MAMDC4, Apical endosomal glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAMDC4Q6UXC1 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MAMDC4Q6UXC1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MAMDC4Q6UXC1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MAMDC4Q6UXC1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MAMDC4Q6UXC1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MAMDC4Q6UXC1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MAMDC4Q6UXC1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MAMDC4Q6UXC1 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MAMDC4Q6UXC1 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MAMDC4Q6UXC1 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MAMDC4Q6UXC1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MAMDC4Q6UXC1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MAMDC4Q6UXC1 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.61
MAMDC4Q6UXC1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MAMDC4Q6UXC1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MAMDC4Q6UXC1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MAMDC4Q6UXC1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MAMDC4Q6UXC1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MAMDC4Q6UXC1 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MAMDC4Q6UXC1 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MAMDC4Q6UXC1 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MAMDC4Q6UXC1 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MAMDC4Q6UXC1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MAMDC4Q6UXC1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MAMDC4Q6UXC1 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MAMDC4Q6UXC1 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MAMDC4Q6UXC1 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MAMDC4Q6UXC1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MAMDC4Q6UXC1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MAMDC4Q6UXC1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MAMDC4Q6UXC1 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MAMDC4Q6UXC1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MAMDC4Q6UXC1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MAMDC4Q6UXC1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
MAMDC4Q6UXC1 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MAMDC4Q6UXC1 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MAMDC4Q6UXC1 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MAMDC4Q6UXC1 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MAMDC4Q6UXC1 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
MAMDC4Q6UXC1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MAMDC4Q6UXC1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MAMDC4Q6UXC1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MAMDC4Q6UXC1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MAMDC4Q6UXC1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MAMDC4Q6UXC1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MAMDC4Q6UXC1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MAMDC4Q6UXC1 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MAMDC4Q6UXC1 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MAMDC4Q6UXC1 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MAMDC4Q6UXC1 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MAMDC4Q6UXC1 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MAMDC4Q6UXC1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MAMDC4Q6UXC1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MAMDC4Q6UXC1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MAMDC4Q6UXC1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MAMDC4Q6UXC1 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MAMDC4Q6UXC1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MAMDC4Q6UXC1 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MAMDC4Q6UXC1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MAMDC4Q6UXC1 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
MAMDC4Q6UXC1 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MAMDC4Q6UXC1 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MAMDC4Q6UXC1 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
MAMDC4Q6UXC1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MAMDC4Q6UXC1 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
MAMDC4Q6UXC1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MAMDC4Q6UXC1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MAMDC4Q6UXC1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MAMDC4Q6UXC1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MAMDC4Q6UXC1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MAMDC4Q6UXC1 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MAMDC4Q6UXC1 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MAMDC4Q6UXC1 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MAMDC4Q6UXC1 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MAMDC4Q6UXC1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MAMDC4Q6UXC1 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MAMDC4Q6UXC1 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MAMDC4Q6UXC1 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MAMDC4Q6UXC1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MAMDC4Q6UXC1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MAMDC4Q6UXC1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MAMDC4Q6UXC1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MAMDC4Q6UXC1 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MAMDC4Q6UXC1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MAMDC4Q6UXC1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MAMDC4Q6UXC1 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MAMDC4Q6UXC1 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MAMDC4Q6UXC1 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MAMDC4Q6UXC1 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MAMDC4Q6UXC1 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MAMDC4Q6UXC1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MAMDC4Q6UXC1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MAMDC4Q6UXC1 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
MAMDC4Q6UXC1 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MAMDC4Q6UXC1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MAMDC4Q6UXC1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MAMDC4Q6UXC1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MAMDC4Q6UXC1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MAMDC4Q6UXC1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MAMDC4Q6UXC1 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms