Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIU1

KCNV1, Potassium voltage-gated channel subfamily V member 1, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNV1Q6PIU1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCNV1Q6PIU1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCNV1Q6PIU1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCNV1Q6PIU1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCNV1Q6PIU1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KCNV1Q6PIU1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KCNV1Q6PIU1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KCNV1Q6PIU1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KCNV1Q6PIU1 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KCNV1Q6PIU1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KCNV1Q6PIU1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KCNV1Q6PIU1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KCNV1Q6PIU1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KCNV1Q6PIU1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KCNV1Q6PIU1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KCNV1Q6PIU1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
KCNV1Q6PIU1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KCNV1Q6PIU1 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KCNV1Q6PIU1 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
KCNV1Q6PIU1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KCNV1Q6PIU1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KCNV1Q6PIU1 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
KCNV1Q6PIU1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KCNV1Q6PIU1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KCNV1Q6PIU1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KCNV1Q6PIU1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KCNV1Q6PIU1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KCNV1Q6PIU1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KCNV1Q6PIU1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KCNV1Q6PIU1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KCNV1Q6PIU1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KCNV1Q6PIU1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KCNV1Q6PIU1 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KCNV1Q6PIU1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KCNV1Q6PIU1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KCNV1Q6PIU1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KCNV1Q6PIU1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KCNV1Q6PIU1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KCNV1Q6PIU1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KCNV1Q6PIU1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KCNV1Q6PIU1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KCNV1Q6PIU1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KCNV1Q6PIU1 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KCNV1Q6PIU1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
KCNV1Q6PIU1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KCNV1Q6PIU1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KCNV1Q6PIU1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KCNV1Q6PIU1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KCNV1Q6PIU1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KCNV1Q6PIU1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
KCNV1Q6PIU1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KCNV1Q6PIU1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KCNV1Q6PIU1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KCNV1Q6PIU1 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KCNV1Q6PIU1 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
KCNV1Q6PIU1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KCNV1Q6PIU1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KCNV1Q6PIU1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KCNV1Q6PIU1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KCNV1Q6PIU1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KCNV1Q6PIU1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
KCNV1Q6PIU1 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KCNV1Q6PIU1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KCNV1Q6PIU1 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25■■□□□ 1.59
KCNV1Q6PIU1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KCNV1Q6PIU1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25■■□□□ 1.59
KCNV1Q6PIU1 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KCNV1Q6PIU1 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KCNV1Q6PIU1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
KCNV1Q6PIU1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KCNV1Q6PIU1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KCNV1Q6PIU1 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KCNV1Q6PIU1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KCNV1Q6PIU1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KCNV1Q6PIU1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KCNV1Q6PIU1 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
KCNV1Q6PIU1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCNV1Q6PIU1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCNV1Q6PIU1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCNV1Q6PIU1 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCNV1Q6PIU1 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCNV1Q6PIU1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCNV1Q6PIU1 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCNV1Q6PIU1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCNV1Q6PIU1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCNV1Q6PIU1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCNV1Q6PIU1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCNV1Q6PIU1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KCNV1Q6PIU1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KCNV1Q6PIU1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KCNV1Q6PIU1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KCNV1Q6PIU1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KCNV1Q6PIU1 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KCNV1Q6PIU1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KCNV1Q6PIU1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCNV1Q6PIU1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCNV1Q6PIU1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCNV1Q6PIU1 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCNV1Q6PIU1 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCNV1Q6PIU1 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms