Protein–RNA interactions for Protein: Q69YQ0

SPECC1L, Cytospin-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPECC1LQ69YQ0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPECC1LQ69YQ0 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPECC1LQ69YQ0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPECC1LQ69YQ0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPECC1LQ69YQ0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPECC1LQ69YQ0 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPECC1LQ69YQ0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPECC1LQ69YQ0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPECC1LQ69YQ0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPECC1LQ69YQ0 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPECC1LQ69YQ0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPECC1LQ69YQ0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SPECC1LQ69YQ0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPECC1LQ69YQ0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPECC1LQ69YQ0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SPECC1LQ69YQ0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPECC1LQ69YQ0 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPECC1LQ69YQ0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPECC1LQ69YQ0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPECC1LQ69YQ0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPECC1LQ69YQ0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPECC1LQ69YQ0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPECC1LQ69YQ0 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPECC1LQ69YQ0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPECC1LQ69YQ0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPECC1LQ69YQ0 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPECC1LQ69YQ0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPECC1LQ69YQ0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPECC1LQ69YQ0 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPECC1LQ69YQ0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SPECC1LQ69YQ0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPECC1LQ69YQ0 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPECC1LQ69YQ0 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPECC1LQ69YQ0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPECC1LQ69YQ0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPECC1LQ69YQ0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPECC1LQ69YQ0 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPECC1LQ69YQ0 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPECC1LQ69YQ0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPECC1LQ69YQ0 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPECC1LQ69YQ0 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPECC1LQ69YQ0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPECC1LQ69YQ0 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPECC1LQ69YQ0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPECC1LQ69YQ0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPECC1LQ69YQ0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPECC1LQ69YQ0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPECC1LQ69YQ0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPECC1LQ69YQ0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPECC1LQ69YQ0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPECC1LQ69YQ0 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPECC1LQ69YQ0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPECC1LQ69YQ0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPECC1LQ69YQ0 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPECC1LQ69YQ0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPECC1LQ69YQ0 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPECC1LQ69YQ0 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPECC1LQ69YQ0 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPECC1LQ69YQ0 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPECC1LQ69YQ0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPECC1LQ69YQ0 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPECC1LQ69YQ0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SPECC1LQ69YQ0 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SPECC1LQ69YQ0 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPECC1LQ69YQ0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPECC1LQ69YQ0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPECC1LQ69YQ0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SPECC1LQ69YQ0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SPECC1LQ69YQ0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPECC1LQ69YQ0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SPECC1LQ69YQ0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SPECC1LQ69YQ0 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPECC1LQ69YQ0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPECC1LQ69YQ0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPECC1LQ69YQ0 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPECC1LQ69YQ0 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPECC1LQ69YQ0 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPECC1LQ69YQ0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPECC1LQ69YQ0 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPECC1LQ69YQ0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPECC1LQ69YQ0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPECC1LQ69YQ0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SPECC1LQ69YQ0 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPECC1LQ69YQ0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPECC1LQ69YQ0 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPECC1LQ69YQ0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPECC1LQ69YQ0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPECC1LQ69YQ0 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPECC1LQ69YQ0 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPECC1LQ69YQ0 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPECC1LQ69YQ0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPECC1LQ69YQ0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPECC1LQ69YQ0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SPECC1LQ69YQ0 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPECC1LQ69YQ0 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPECC1LQ69YQ0 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPECC1LQ69YQ0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPECC1LQ69YQ0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPECC1LQ69YQ0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPECC1LQ69YQ0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms