Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP2

FAM46C, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46CQ5VWP2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM46CQ5VWP2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM46CQ5VWP2 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM46CQ5VWP2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM46CQ5VWP2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM46CQ5VWP2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM46CQ5VWP2 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM46CQ5VWP2 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM46CQ5VWP2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM46CQ5VWP2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM46CQ5VWP2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM46CQ5VWP2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM46CQ5VWP2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM46CQ5VWP2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM46CQ5VWP2 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM46CQ5VWP2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM46CQ5VWP2 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM46CQ5VWP2 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM46CQ5VWP2 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM46CQ5VWP2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM46CQ5VWP2 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM46CQ5VWP2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM46CQ5VWP2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM46CQ5VWP2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM46CQ5VWP2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM46CQ5VWP2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM46CQ5VWP2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM46CQ5VWP2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM46CQ5VWP2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM46CQ5VWP2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM46CQ5VWP2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM46CQ5VWP2 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM46CQ5VWP2 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM46CQ5VWP2 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM46CQ5VWP2 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM46CQ5VWP2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM46CQ5VWP2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM46CQ5VWP2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM46CQ5VWP2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM46CQ5VWP2 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM46CQ5VWP2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM46CQ5VWP2 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM46CQ5VWP2 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM46CQ5VWP2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM46CQ5VWP2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM46CQ5VWP2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM46CQ5VWP2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM46CQ5VWP2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM46CQ5VWP2 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM46CQ5VWP2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM46CQ5VWP2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM46CQ5VWP2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM46CQ5VWP2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM46CQ5VWP2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM46CQ5VWP2 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM46CQ5VWP2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM46CQ5VWP2 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM46CQ5VWP2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM46CQ5VWP2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM46CQ5VWP2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM46CQ5VWP2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM46CQ5VWP2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM46CQ5VWP2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM46CQ5VWP2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM46CQ5VWP2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM46CQ5VWP2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM46CQ5VWP2 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM46CQ5VWP2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM46CQ5VWP2 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM46CQ5VWP2 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM46CQ5VWP2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM46CQ5VWP2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM46CQ5VWP2 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM46CQ5VWP2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM46CQ5VWP2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
FAM46CQ5VWP2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
FAM46CQ5VWP2 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM46CQ5VWP2 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM46CQ5VWP2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM46CQ5VWP2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM46CQ5VWP2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM46CQ5VWP2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM46CQ5VWP2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM46CQ5VWP2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM46CQ5VWP2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM46CQ5VWP2 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM46CQ5VWP2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM46CQ5VWP2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM46CQ5VWP2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM46CQ5VWP2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM46CQ5VWP2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM46CQ5VWP2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM46CQ5VWP2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM46CQ5VWP2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM46CQ5VWP2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM46CQ5VWP2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM46CQ5VWP2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM46CQ5VWP2 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM46CQ5VWP2 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM46CQ5VWP2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms