Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUE5

C1orf53, Uncharacterized protein C1orf53, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf53Q5VUE5 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C1orf53Q5VUE5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
C1orf53Q5VUE5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
C1orf53Q5VUE5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C1orf53Q5VUE5 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C1orf53Q5VUE5 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
C1orf53Q5VUE5 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
C1orf53Q5VUE5 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
C1orf53Q5VUE5 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
C1orf53Q5VUE5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C1orf53Q5VUE5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
C1orf53Q5VUE5 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
C1orf53Q5VUE5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
C1orf53Q5VUE5 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
C1orf53Q5VUE5 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
C1orf53Q5VUE5 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C1orf53Q5VUE5 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C1orf53Q5VUE5 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C1orf53Q5VUE5 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C1orf53Q5VUE5 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C1orf53Q5VUE5 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
C1orf53Q5VUE5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C1orf53Q5VUE5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C1orf53Q5VUE5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C1orf53Q5VUE5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C1orf53Q5VUE5 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C1orf53Q5VUE5 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C1orf53Q5VUE5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C1orf53Q5VUE5 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C1orf53Q5VUE5 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C1orf53Q5VUE5 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C1orf53Q5VUE5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C1orf53Q5VUE5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C1orf53Q5VUE5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C1orf53Q5VUE5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C1orf53Q5VUE5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C1orf53Q5VUE5 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C1orf53Q5VUE5 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C1orf53Q5VUE5 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C1orf53Q5VUE5 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C1orf53Q5VUE5 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C1orf53Q5VUE5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C1orf53Q5VUE5 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C1orf53Q5VUE5 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C1orf53Q5VUE5 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C1orf53Q5VUE5 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C1orf53Q5VUE5 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C1orf53Q5VUE5 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
C1orf53Q5VUE5 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C1orf53Q5VUE5 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
C1orf53Q5VUE5 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C1orf53Q5VUE5 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C1orf53Q5VUE5 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C1orf53Q5VUE5 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C1orf53Q5VUE5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C1orf53Q5VUE5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C1orf53Q5VUE5 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C1orf53Q5VUE5 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C1orf53Q5VUE5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C1orf53Q5VUE5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C1orf53Q5VUE5 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C1orf53Q5VUE5 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C1orf53Q5VUE5 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C1orf53Q5VUE5 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C1orf53Q5VUE5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C1orf53Q5VUE5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C1orf53Q5VUE5 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C1orf53Q5VUE5 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C1orf53Q5VUE5 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C1orf53Q5VUE5 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C1orf53Q5VUE5 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C1orf53Q5VUE5 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C1orf53Q5VUE5 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C1orf53Q5VUE5 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C1orf53Q5VUE5 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C1orf53Q5VUE5 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C1orf53Q5VUE5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C1orf53Q5VUE5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C1orf53Q5VUE5 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
C1orf53Q5VUE5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
C1orf53Q5VUE5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C1orf53Q5VUE5 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C1orf53Q5VUE5 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C1orf53Q5VUE5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C1orf53Q5VUE5 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C1orf53Q5VUE5 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C1orf53Q5VUE5 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C1orf53Q5VUE5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C1orf53Q5VUE5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C1orf53Q5VUE5 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C1orf53Q5VUE5 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C1orf53Q5VUE5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C1orf53Q5VUE5 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C1orf53Q5VUE5 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C1orf53Q5VUE5 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C1orf53Q5VUE5 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C1orf53Q5VUE5 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C1orf53Q5VUE5 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
C1orf53Q5VUE5 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C1orf53Q5VUE5 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms