Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT99

LRRC38, Leucine-rich repeat-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC38Q5VT99 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC38Q5VT99 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC38Q5VT99 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC38Q5VT99 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC38Q5VT99 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC38Q5VT99 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC38Q5VT99 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC38Q5VT99 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC38Q5VT99 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC38Q5VT99 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC38Q5VT99 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC38Q5VT99 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC38Q5VT99 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC38Q5VT99 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC38Q5VT99 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC38Q5VT99 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC38Q5VT99 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC38Q5VT99 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC38Q5VT99 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC38Q5VT99 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC38Q5VT99 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC38Q5VT99 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC38Q5VT99 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC38Q5VT99 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC38Q5VT99 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC38Q5VT99 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC38Q5VT99 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC38Q5VT99 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC38Q5VT99 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC38Q5VT99 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC38Q5VT99 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC38Q5VT99 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC38Q5VT99 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC38Q5VT99 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC38Q5VT99 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC38Q5VT99 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC38Q5VT99 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC38Q5VT99 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC38Q5VT99 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC38Q5VT99 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC38Q5VT99 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC38Q5VT99 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC38Q5VT99 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC38Q5VT99 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC38Q5VT99 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC38Q5VT99 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC38Q5VT99 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC38Q5VT99 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC38Q5VT99 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC38Q5VT99 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC38Q5VT99 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC38Q5VT99 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC38Q5VT99 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC38Q5VT99 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC38Q5VT99 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC38Q5VT99 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC38Q5VT99 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC38Q5VT99 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC38Q5VT99 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC38Q5VT99 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC38Q5VT99 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC38Q5VT99 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC38Q5VT99 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC38Q5VT99 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC38Q5VT99 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC38Q5VT99 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC38Q5VT99 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC38Q5VT99 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC38Q5VT99 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC38Q5VT99 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC38Q5VT99 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC38Q5VT99 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC38Q5VT99 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC38Q5VT99 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC38Q5VT99 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC38Q5VT99 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC38Q5VT99 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC38Q5VT99 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC38Q5VT99 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC38Q5VT99 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC38Q5VT99 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC38Q5VT99 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC38Q5VT99 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC38Q5VT99 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC38Q5VT99 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC38Q5VT99 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC38Q5VT99 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC38Q5VT99 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC38Q5VT99 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC38Q5VT99 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC38Q5VT99 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC38Q5VT99 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC38Q5VT99 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC38Q5VT99 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC38Q5VT99 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC38Q5VT99 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC38Q5VT99 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC38Q5VT99 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC38Q5VT99 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC38Q5VT99 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms