Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0U0

CCDC122, Coiled-coil domain-containing protein 122, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC122Q5T0U0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC122Q5T0U0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC122Q5T0U0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC122Q5T0U0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC122Q5T0U0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC122Q5T0U0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC122Q5T0U0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC122Q5T0U0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC122Q5T0U0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC122Q5T0U0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC122Q5T0U0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC122Q5T0U0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC122Q5T0U0 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC122Q5T0U0 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC122Q5T0U0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC122Q5T0U0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC122Q5T0U0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC122Q5T0U0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC122Q5T0U0 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC122Q5T0U0 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC122Q5T0U0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC122Q5T0U0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC122Q5T0U0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC122Q5T0U0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC122Q5T0U0 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC122Q5T0U0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC122Q5T0U0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC122Q5T0U0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC122Q5T0U0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC122Q5T0U0 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC122Q5T0U0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC122Q5T0U0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC122Q5T0U0 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC122Q5T0U0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC122Q5T0U0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC122Q5T0U0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC122Q5T0U0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC122Q5T0U0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC122Q5T0U0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC122Q5T0U0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC122Q5T0U0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC122Q5T0U0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC122Q5T0U0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC122Q5T0U0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC122Q5T0U0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC122Q5T0U0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC122Q5T0U0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC122Q5T0U0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC122Q5T0U0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC122Q5T0U0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC122Q5T0U0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC122Q5T0U0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC122Q5T0U0 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC122Q5T0U0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC122Q5T0U0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC122Q5T0U0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC122Q5T0U0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC122Q5T0U0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC122Q5T0U0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC122Q5T0U0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC122Q5T0U0 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC122Q5T0U0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC122Q5T0U0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC122Q5T0U0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC122Q5T0U0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC122Q5T0U0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC122Q5T0U0 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC122Q5T0U0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC122Q5T0U0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC122Q5T0U0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC122Q5T0U0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC122Q5T0U0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC122Q5T0U0 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC122Q5T0U0 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC122Q5T0U0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC122Q5T0U0 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC122Q5T0U0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC122Q5T0U0 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC122Q5T0U0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC122Q5T0U0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC122Q5T0U0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC122Q5T0U0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC122Q5T0U0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC122Q5T0U0 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC122Q5T0U0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC122Q5T0U0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC122Q5T0U0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC122Q5T0U0 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC122Q5T0U0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC122Q5T0U0 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC122Q5T0U0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC122Q5T0U0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC122Q5T0U0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC122Q5T0U0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC122Q5T0U0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC122Q5T0U0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC122Q5T0U0 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC122Q5T0U0 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC122Q5T0U0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC122Q5T0U0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms