Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

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Length 151 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C10orf55Q5SWW7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C10orf55Q5SWW7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C10orf55Q5SWW7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C10orf55Q5SWW7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C10orf55Q5SWW7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C10orf55Q5SWW7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C10orf55Q5SWW7 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
C10orf55Q5SWW7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
C10orf55Q5SWW7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C10orf55Q5SWW7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C10orf55Q5SWW7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C10orf55Q5SWW7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C10orf55Q5SWW7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C10orf55Q5SWW7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C10orf55Q5SWW7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C10orf55Q5SWW7 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C10orf55Q5SWW7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C10orf55Q5SWW7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C10orf55Q5SWW7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C10orf55Q5SWW7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
C10orf55Q5SWW7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
C10orf55Q5SWW7 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C10orf55Q5SWW7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
C10orf55Q5SWW7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C10orf55Q5SWW7 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C10orf55Q5SWW7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
C10orf55Q5SWW7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C10orf55Q5SWW7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C10orf55Q5SWW7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
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C10orf55Q5SWW7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
C10orf55Q5SWW7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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C10orf55Q5SWW7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
C10orf55Q5SWW7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C10orf55Q5SWW7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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C10orf55Q5SWW7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C10orf55Q5SWW7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C10orf55Q5SWW7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C10orf55Q5SWW7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
C10orf55Q5SWW7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C10orf55Q5SWW7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
C10orf55Q5SWW7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
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C10orf55Q5SWW7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C10orf55Q5SWW7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C10orf55Q5SWW7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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C10orf55Q5SWW7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
C10orf55Q5SWW7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C10orf55Q5SWW7 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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C10orf55Q5SWW7 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C10orf55Q5SWW7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C10orf55Q5SWW7 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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C10orf55Q5SWW7 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C10orf55Q5SWW7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C10orf55Q5SWW7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C10orf55Q5SWW7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C10orf55Q5SWW7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C10orf55Q5SWW7 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C10orf55Q5SWW7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C10orf55Q5SWW7 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
C10orf55Q5SWW7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C10orf55Q5SWW7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C10orf55Q5SWW7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C10orf55Q5SWW7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
C10orf55Q5SWW7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C10orf55Q5SWW7 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C10orf55Q5SWW7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C10orf55Q5SWW7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C10orf55Q5SWW7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C10orf55Q5SWW7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C10orf55Q5SWW7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
C10orf55Q5SWW7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C10orf55Q5SWW7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C10orf55Q5SWW7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C10orf55Q5SWW7 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C10orf55Q5SWW7 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C10orf55Q5SWW7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C10orf55Q5SWW7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C10orf55Q5SWW7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
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