Protein–RNA interactions for Protein: Q5NUL3

FFAR4, Free fatty acid receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FFAR4Q5NUL3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FFAR4Q5NUL3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FFAR4Q5NUL3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FFAR4Q5NUL3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FFAR4Q5NUL3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FFAR4Q5NUL3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FFAR4Q5NUL3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FFAR4Q5NUL3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FFAR4Q5NUL3 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FFAR4Q5NUL3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FFAR4Q5NUL3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FFAR4Q5NUL3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FFAR4Q5NUL3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
FFAR4Q5NUL3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FFAR4Q5NUL3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FFAR4Q5NUL3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FFAR4Q5NUL3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FFAR4Q5NUL3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FFAR4Q5NUL3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FFAR4Q5NUL3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
FFAR4Q5NUL3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
FFAR4Q5NUL3 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FFAR4Q5NUL3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FFAR4Q5NUL3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FFAR4Q5NUL3 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FFAR4Q5NUL3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FFAR4Q5NUL3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FFAR4Q5NUL3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FFAR4Q5NUL3 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FFAR4Q5NUL3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FFAR4Q5NUL3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FFAR4Q5NUL3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FFAR4Q5NUL3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FFAR4Q5NUL3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FFAR4Q5NUL3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FFAR4Q5NUL3 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FFAR4Q5NUL3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FFAR4Q5NUL3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FFAR4Q5NUL3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FFAR4Q5NUL3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FFAR4Q5NUL3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FFAR4Q5NUL3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FFAR4Q5NUL3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FFAR4Q5NUL3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FFAR4Q5NUL3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FFAR4Q5NUL3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FFAR4Q5NUL3 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FFAR4Q5NUL3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FFAR4Q5NUL3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FFAR4Q5NUL3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FFAR4Q5NUL3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FFAR4Q5NUL3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FFAR4Q5NUL3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FFAR4Q5NUL3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FFAR4Q5NUL3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FFAR4Q5NUL3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FFAR4Q5NUL3 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FFAR4Q5NUL3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FFAR4Q5NUL3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FFAR4Q5NUL3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FFAR4Q5NUL3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FFAR4Q5NUL3 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FFAR4Q5NUL3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FFAR4Q5NUL3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FFAR4Q5NUL3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FFAR4Q5NUL3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FFAR4Q5NUL3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FFAR4Q5NUL3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FFAR4Q5NUL3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FFAR4Q5NUL3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FFAR4Q5NUL3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FFAR4Q5NUL3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FFAR4Q5NUL3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FFAR4Q5NUL3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FFAR4Q5NUL3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FFAR4Q5NUL3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FFAR4Q5NUL3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FFAR4Q5NUL3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FFAR4Q5NUL3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FFAR4Q5NUL3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FFAR4Q5NUL3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.39
FFAR4Q5NUL3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
FFAR4Q5NUL3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
FFAR4Q5NUL3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FFAR4Q5NUL3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FFAR4Q5NUL3 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FFAR4Q5NUL3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FFAR4Q5NUL3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FFAR4Q5NUL3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FFAR4Q5NUL3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FFAR4Q5NUL3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FFAR4Q5NUL3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FFAR4Q5NUL3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FFAR4Q5NUL3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FFAR4Q5NUL3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FFAR4Q5NUL3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FFAR4Q5NUL3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FFAR4Q5NUL3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FFAR4Q5NUL3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FFAR4Q5NUL3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms