Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DUSP28Q4G0W2 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DUSP28Q4G0W2 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DUSP28Q4G0W2 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DUSP28Q4G0W2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DUSP28Q4G0W2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DUSP28Q4G0W2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DUSP28Q4G0W2 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DUSP28Q4G0W2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DUSP28Q4G0W2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DUSP28Q4G0W2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DUSP28Q4G0W2 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DUSP28Q4G0W2 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DUSP28Q4G0W2 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DUSP28Q4G0W2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DUSP28Q4G0W2 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DUSP28Q4G0W2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DUSP28Q4G0W2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DUSP28Q4G0W2 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DUSP28Q4G0W2 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DUSP28Q4G0W2 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DUSP28Q4G0W2 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
DUSP28Q4G0W2 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DUSP28Q4G0W2 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DUSP28Q4G0W2 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DUSP28Q4G0W2 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DUSP28Q4G0W2 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DUSP28Q4G0W2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DUSP28Q4G0W2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DUSP28Q4G0W2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DUSP28Q4G0W2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DUSP28Q4G0W2 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DUSP28Q4G0W2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DUSP28Q4G0W2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DUSP28Q4G0W2 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DUSP28Q4G0W2 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DUSP28Q4G0W2 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DUSP28Q4G0W2 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DUSP28Q4G0W2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DUSP28Q4G0W2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
DUSP28Q4G0W2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DUSP28Q4G0W2 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DUSP28Q4G0W2 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DUSP28Q4G0W2 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DUSP28Q4G0W2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
DUSP28Q4G0W2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
DUSP28Q4G0W2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
DUSP28Q4G0W2 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DUSP28Q4G0W2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DUSP28Q4G0W2 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DUSP28Q4G0W2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DUSP28Q4G0W2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DUSP28Q4G0W2 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DUSP28Q4G0W2 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DUSP28Q4G0W2 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DUSP28Q4G0W2 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DUSP28Q4G0W2 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DUSP28Q4G0W2 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DUSP28Q4G0W2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DUSP28Q4G0W2 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DUSP28Q4G0W2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DUSP28Q4G0W2 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DUSP28Q4G0W2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DUSP28Q4G0W2 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DUSP28Q4G0W2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DUSP28Q4G0W2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DUSP28Q4G0W2 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DUSP28Q4G0W2 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DUSP28Q4G0W2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DUSP28Q4G0W2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DUSP28Q4G0W2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
DUSP28Q4G0W2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DUSP28Q4G0W2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DUSP28Q4G0W2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DUSP28Q4G0W2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DUSP28Q4G0W2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DUSP28Q4G0W2 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DUSP28Q4G0W2 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DUSP28Q4G0W2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DUSP28Q4G0W2 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DUSP28Q4G0W2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DUSP28Q4G0W2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DUSP28Q4G0W2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DUSP28Q4G0W2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DUSP28Q4G0W2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DUSP28Q4G0W2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DUSP28Q4G0W2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DUSP28Q4G0W2 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DUSP28Q4G0W2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DUSP28Q4G0W2 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DUSP28Q4G0W2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DUSP28Q4G0W2 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DUSP28Q4G0W2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DUSP28Q4G0W2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DUSP28Q4G0W2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DUSP28Q4G0W2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DUSP28Q4G0W2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DUSP28Q4G0W2 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DUSP28Q4G0W2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
DUSP28Q4G0W2 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms