Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPK5

CTU2, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2Q2VPK5 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTU2Q2VPK5 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTU2Q2VPK5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTU2Q2VPK5 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTU2Q2VPK5 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTU2Q2VPK5 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTU2Q2VPK5 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTU2Q2VPK5 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTU2Q2VPK5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CTU2Q2VPK5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CTU2Q2VPK5 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTU2Q2VPK5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTU2Q2VPK5 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTU2Q2VPK5 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTU2Q2VPK5 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTU2Q2VPK5 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTU2Q2VPK5 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTU2Q2VPK5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTU2Q2VPK5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTU2Q2VPK5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTU2Q2VPK5 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTU2Q2VPK5 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTU2Q2VPK5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTU2Q2VPK5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTU2Q2VPK5 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTU2Q2VPK5 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTU2Q2VPK5 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTU2Q2VPK5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTU2Q2VPK5 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTU2Q2VPK5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
CTU2Q2VPK5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTU2Q2VPK5 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTU2Q2VPK5 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTU2Q2VPK5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTU2Q2VPK5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTU2Q2VPK5 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTU2Q2VPK5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTU2Q2VPK5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTU2Q2VPK5 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTU2Q2VPK5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTU2Q2VPK5 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTU2Q2VPK5 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTU2Q2VPK5 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTU2Q2VPK5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTU2Q2VPK5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTU2Q2VPK5 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTU2Q2VPK5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CTU2Q2VPK5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTU2Q2VPK5 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTU2Q2VPK5 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTU2Q2VPK5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CTU2Q2VPK5 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CTU2Q2VPK5 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
CTU2Q2VPK5 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTU2Q2VPK5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTU2Q2VPK5 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTU2Q2VPK5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTU2Q2VPK5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTU2Q2VPK5 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
CTU2Q2VPK5 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTU2Q2VPK5 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
CTU2Q2VPK5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTU2Q2VPK5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTU2Q2VPK5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTU2Q2VPK5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTU2Q2VPK5 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTU2Q2VPK5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTU2Q2VPK5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTU2Q2VPK5 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTU2Q2VPK5 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTU2Q2VPK5 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CTU2Q2VPK5 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CTU2Q2VPK5 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CTU2Q2VPK5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CTU2Q2VPK5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CTU2Q2VPK5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CTU2Q2VPK5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CTU2Q2VPK5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CTU2Q2VPK5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
CTU2Q2VPK5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CTU2Q2VPK5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
CTU2Q2VPK5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CTU2Q2VPK5 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CTU2Q2VPK5 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CTU2Q2VPK5 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CTU2Q2VPK5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CTU2Q2VPK5 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CTU2Q2VPK5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CTU2Q2VPK5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CTU2Q2VPK5 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CTU2Q2VPK5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CTU2Q2VPK5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CTU2Q2VPK5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CTU2Q2VPK5 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTU2Q2VPK5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTU2Q2VPK5 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTU2Q2VPK5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTU2Q2VPK5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTU2Q2VPK5 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTU2Q2VPK5 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
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