Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FSCN1Q16658 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FSCN1Q16658 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FSCN1Q16658 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FSCN1Q16658 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FSCN1Q16658 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FSCN1Q16658 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FSCN1Q16658 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FSCN1Q16658 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FSCN1Q16658 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FSCN1Q16658 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FSCN1Q16658 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FSCN1Q16658 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FSCN1Q16658 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FSCN1Q16658 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FSCN1Q16658 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FSCN1Q16658 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FSCN1Q16658 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FSCN1Q16658 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FSCN1Q16658 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FSCN1Q16658 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FSCN1Q16658 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FSCN1Q16658 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FSCN1Q16658 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FSCN1Q16658 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FSCN1Q16658 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FSCN1Q16658 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FSCN1Q16658 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FSCN1Q16658 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FSCN1Q16658 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FSCN1Q16658 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FSCN1Q16658 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FSCN1Q16658 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FSCN1Q16658 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FSCN1Q16658 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FSCN1Q16658 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
FSCN1Q16658 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FSCN1Q16658 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FSCN1Q16658 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FSCN1Q16658 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FSCN1Q16658 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FSCN1Q16658 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FSCN1Q16658 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FSCN1Q16658 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FSCN1Q16658 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FSCN1Q16658 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FSCN1Q16658 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FSCN1Q16658 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FSCN1Q16658 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FSCN1Q16658 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FSCN1Q16658 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FSCN1Q16658 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FSCN1Q16658 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FSCN1Q16658 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FSCN1Q16658 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FSCN1Q16658 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
FSCN1Q16658 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FSCN1Q16658 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FSCN1Q16658 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FSCN1Q16658 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FSCN1Q16658 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FSCN1Q16658 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FSCN1Q16658 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FSCN1Q16658 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FSCN1Q16658 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FSCN1Q16658 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FSCN1Q16658 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FSCN1Q16658 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FSCN1Q16658 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FSCN1Q16658 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FSCN1Q16658 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FSCN1Q16658 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FSCN1Q16658 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FSCN1Q16658 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FSCN1Q16658 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FSCN1Q16658 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FSCN1Q16658 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FSCN1Q16658 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FSCN1Q16658 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FSCN1Q16658 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
FSCN1Q16658 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FSCN1Q16658 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FSCN1Q16658 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FSCN1Q16658 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FSCN1Q16658 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FSCN1Q16658 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FSCN1Q16658 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FSCN1Q16658 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FSCN1Q16658 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FSCN1Q16658 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FSCN1Q16658 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FSCN1Q16658 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FSCN1Q16658 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FSCN1Q16658 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FSCN1Q16658 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FSCN1Q16658 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FSCN1Q16658 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
FSCN1Q16658 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FSCN1Q16658 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FSCN1Q16658 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms