Protein–RNA interactions for Protein: Q16557

PSG3, Pregnancy-specific beta-1-glycoprotein 3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSG3Q16557 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PSG3Q16557 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PSG3Q16557 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PSG3Q16557 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PSG3Q16557 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PSG3Q16557 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PSG3Q16557 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PSG3Q16557 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PSG3Q16557 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PSG3Q16557 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PSG3Q16557 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PSG3Q16557 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PSG3Q16557 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PSG3Q16557 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PSG3Q16557 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PSG3Q16557 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PSG3Q16557 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PSG3Q16557 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PSG3Q16557 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
PSG3Q16557 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
PSG3Q16557 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PSG3Q16557 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSG3Q16557 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSG3Q16557 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSG3Q16557 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSG3Q16557 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSG3Q16557 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSG3Q16557 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSG3Q16557 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSG3Q16557 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSG3Q16557 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PSG3Q16557 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSG3Q16557 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSG3Q16557 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSG3Q16557 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSG3Q16557 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PSG3Q16557 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSG3Q16557 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSG3Q16557 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSG3Q16557 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSG3Q16557 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSG3Q16557 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSG3Q16557 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSG3Q16557 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSG3Q16557 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSG3Q16557 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PSG3Q16557 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSG3Q16557 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSG3Q16557 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSG3Q16557 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSG3Q16557 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSG3Q16557 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSG3Q16557 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSG3Q16557 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSG3Q16557 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSG3Q16557 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSG3Q16557 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSG3Q16557 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSG3Q16557 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSG3Q16557 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSG3Q16557 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSG3Q16557 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSG3Q16557 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSG3Q16557 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSG3Q16557 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSG3Q16557 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSG3Q16557 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSG3Q16557 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSG3Q16557 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSG3Q16557 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSG3Q16557 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSG3Q16557 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSG3Q16557 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSG3Q16557 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSG3Q16557 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSG3Q16557 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PSG3Q16557 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSG3Q16557 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSG3Q16557 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSG3Q16557 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSG3Q16557 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PSG3Q16557 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSG3Q16557 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSG3Q16557 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSG3Q16557 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSG3Q16557 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSG3Q16557 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSG3Q16557 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSG3Q16557 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSG3Q16557 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSG3Q16557 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSG3Q16557 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSG3Q16557 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PSG3Q16557 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSG3Q16557 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSG3Q16557 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSG3Q16557 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSG3Q16557 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSG3Q16557 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSG3Q16557 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms