Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNAPC1Q16533 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNAPC1Q16533 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNAPC1Q16533 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNAPC1Q16533 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNAPC1Q16533 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNAPC1Q16533 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNAPC1Q16533 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SNAPC1Q16533 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNAPC1Q16533 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SNAPC1Q16533 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNAPC1Q16533 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNAPC1Q16533 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNAPC1Q16533 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNAPC1Q16533 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNAPC1Q16533 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNAPC1Q16533 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNAPC1Q16533 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNAPC1Q16533 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNAPC1Q16533 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNAPC1Q16533 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNAPC1Q16533 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNAPC1Q16533 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNAPC1Q16533 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNAPC1Q16533 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNAPC1Q16533 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNAPC1Q16533 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNAPC1Q16533 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNAPC1Q16533 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNAPC1Q16533 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNAPC1Q16533 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNAPC1Q16533 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNAPC1Q16533 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNAPC1Q16533 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNAPC1Q16533 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNAPC1Q16533 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNAPC1Q16533 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNAPC1Q16533 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNAPC1Q16533 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNAPC1Q16533 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNAPC1Q16533 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNAPC1Q16533 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNAPC1Q16533 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNAPC1Q16533 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNAPC1Q16533 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNAPC1Q16533 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNAPC1Q16533 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNAPC1Q16533 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNAPC1Q16533 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNAPC1Q16533 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNAPC1Q16533 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNAPC1Q16533 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNAPC1Q16533 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNAPC1Q16533 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNAPC1Q16533 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNAPC1Q16533 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNAPC1Q16533 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNAPC1Q16533 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNAPC1Q16533 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNAPC1Q16533 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNAPC1Q16533 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNAPC1Q16533 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNAPC1Q16533 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNAPC1Q16533 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNAPC1Q16533 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SNAPC1Q16533 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNAPC1Q16533 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNAPC1Q16533 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNAPC1Q16533 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNAPC1Q16533 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNAPC1Q16533 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SNAPC1Q16533 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SNAPC1Q16533 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SNAPC1Q16533 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNAPC1Q16533 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNAPC1Q16533 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNAPC1Q16533 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNAPC1Q16533 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNAPC1Q16533 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNAPC1Q16533 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SNAPC1Q16533 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNAPC1Q16533 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNAPC1Q16533 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNAPC1Q16533 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNAPC1Q16533 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNAPC1Q16533 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNAPC1Q16533 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNAPC1Q16533 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNAPC1Q16533 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNAPC1Q16533 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNAPC1Q16533 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNAPC1Q16533 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNAPC1Q16533 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNAPC1Q16533 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNAPC1Q16533 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNAPC1Q16533 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNAPC1Q16533 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNAPC1Q16533 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNAPC1Q16533 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNAPC1Q16533 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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