Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Length 980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GRIK5Q16478 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GRIK5Q16478 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GRIK5Q16478 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GRIK5Q16478 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GRIK5Q16478 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GRIK5Q16478 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GRIK5Q16478 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GRIK5Q16478 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GRIK5Q16478 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GRIK5Q16478 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GRIK5Q16478 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GRIK5Q16478 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
GRIK5Q16478 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GRIK5Q16478 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GRIK5Q16478 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GRIK5Q16478 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GRIK5Q16478 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GRIK5Q16478 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GRIK5Q16478 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
GRIK5Q16478 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GRIK5Q16478 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GRIK5Q16478 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GRIK5Q16478 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GRIK5Q16478 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
GRIK5Q16478 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GRIK5Q16478 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GRIK5Q16478 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GRIK5Q16478 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
GRIK5Q16478 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GRIK5Q16478 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GRIK5Q16478 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GRIK5Q16478 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GRIK5Q16478 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GRIK5Q16478 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GRIK5Q16478 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
GRIK5Q16478 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GRIK5Q16478 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GRIK5Q16478 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GRIK5Q16478 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GRIK5Q16478 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GRIK5Q16478 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GRIK5Q16478 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GRIK5Q16478 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
GRIK5Q16478 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GRIK5Q16478 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
GRIK5Q16478 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
GRIK5Q16478 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GRIK5Q16478 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GRIK5Q16478 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GRIK5Q16478 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GRIK5Q16478 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GRIK5Q16478 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GRIK5Q16478 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GRIK5Q16478 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GRIK5Q16478 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GRIK5Q16478 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GRIK5Q16478 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GRIK5Q16478 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GRIK5Q16478 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
GRIK5Q16478 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GRIK5Q16478 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GRIK5Q16478 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
GRIK5Q16478 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GRIK5Q16478 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GRIK5Q16478 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
GRIK5Q16478 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
GRIK5Q16478 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GRIK5Q16478 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GRIK5Q16478 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GRIK5Q16478 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GRIK5Q16478 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GRIK5Q16478 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
GRIK5Q16478 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GRIK5Q16478 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GRIK5Q16478 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GRIK5Q16478 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GRIK5Q16478 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
GRIK5Q16478 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
GRIK5Q16478 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GRIK5Q16478 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GRIK5Q16478 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GRIK5Q16478 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GRIK5Q16478 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GRIK5Q16478 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GRIK5Q16478 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GRIK5Q16478 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
GRIK5Q16478 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GRIK5Q16478 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GRIK5Q16478 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GRIK5Q16478 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GRIK5Q16478 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GRIK5Q16478 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GRIK5Q16478 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GRIK5Q16478 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GRIK5Q16478 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GRIK5Q16478 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GRIK5Q16478 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GRIK5Q16478 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GRIK5Q16478 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
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