Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SCN9AQ15858 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SCN9AQ15858 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SCN9AQ15858 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SCN9AQ15858 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SCN9AQ15858 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SCN9AQ15858 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCN9AQ15858 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCN9AQ15858 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
SCN9AQ15858 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
SCN9AQ15858 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCN9AQ15858 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SCN9AQ15858 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCN9AQ15858 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCN9AQ15858 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCN9AQ15858 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCN9AQ15858 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SCN9AQ15858 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SCN9AQ15858 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SCN9AQ15858 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCN9AQ15858 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCN9AQ15858 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCN9AQ15858 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCN9AQ15858 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SCN9AQ15858 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCN9AQ15858 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCN9AQ15858 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCN9AQ15858 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCN9AQ15858 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCN9AQ15858 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCN9AQ15858 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCN9AQ15858 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCN9AQ15858 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCN9AQ15858 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCN9AQ15858 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCN9AQ15858 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCN9AQ15858 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCN9AQ15858 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCN9AQ15858 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCN9AQ15858 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCN9AQ15858 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCN9AQ15858 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SCN9AQ15858 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCN9AQ15858 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCN9AQ15858 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCN9AQ15858 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCN9AQ15858 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCN9AQ15858 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCN9AQ15858 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCN9AQ15858 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCN9AQ15858 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCN9AQ15858 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SCN9AQ15858 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCN9AQ15858 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SCN9AQ15858 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SCN9AQ15858 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SCN9AQ15858 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SCN9AQ15858 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SCN9AQ15858 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
SCN9AQ15858 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SCN9AQ15858 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SCN9AQ15858 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCN9AQ15858 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCN9AQ15858 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCN9AQ15858 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCN9AQ15858 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCN9AQ15858 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCN9AQ15858 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCN9AQ15858 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCN9AQ15858 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCN9AQ15858 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCN9AQ15858 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCN9AQ15858 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCN9AQ15858 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SCN9AQ15858 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCN9AQ15858 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCN9AQ15858 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCN9AQ15858 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCN9AQ15858 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCN9AQ15858 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCN9AQ15858 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCN9AQ15858 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCN9AQ15858 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCN9AQ15858 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCN9AQ15858 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCN9AQ15858 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCN9AQ15858 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCN9AQ15858 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCN9AQ15858 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCN9AQ15858 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCN9AQ15858 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCN9AQ15858 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCN9AQ15858 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCN9AQ15858 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCN9AQ15858 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCN9AQ15858 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SCN9AQ15858 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCN9AQ15858 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCN9AQ15858 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCN9AQ15858 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
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