Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
NCOA1Q15788 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC33.44■■■□□ 2.94
NCOA1Q15788 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
NCOA1Q15788 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
NCOA1Q15788 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
NCOA1Q15788 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
NCOA1Q15788 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
NCOA1Q15788 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
NCOA1Q15788 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
NCOA1Q15788 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
NCOA1Q15788 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
NCOA1Q15788 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
NCOA1Q15788 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
NCOA1Q15788 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
NCOA1Q15788 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
NCOA1Q15788 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
NCOA1Q15788 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
NCOA1Q15788 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
NCOA1Q15788 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
NCOA1Q15788 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
NCOA1Q15788 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
NCOA1Q15788 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
NCOA1Q15788 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
NCOA1Q15788 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
NCOA1Q15788 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
NCOA1Q15788 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
NCOA1Q15788 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
NCOA1Q15788 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC33.41■■■□□ 2.94
NCOA1Q15788 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
NCOA1Q15788 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
NCOA1Q15788 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
NCOA1Q15788 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
NCOA1Q15788 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
NCOA1Q15788 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
NCOA1Q15788 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
NCOA1Q15788 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
NCOA1Q15788 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
NCOA1Q15788 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
NCOA1Q15788 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
NCOA1Q15788 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
NCOA1Q15788 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
NCOA1Q15788 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
NCOA1Q15788 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
NCOA1Q15788 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
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NCOA1Q15788 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
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NCOA1Q15788 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
NCOA1Q15788 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
NCOA1Q15788 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
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NCOA1Q15788 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
NCOA1Q15788 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
NCOA1Q15788 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
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NCOA1Q15788 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
NCOA1Q15788 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
NCOA1Q15788 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
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NCOA1Q15788 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
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NCOA1Q15788 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
NCOA1Q15788 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
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NCOA1Q15788 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC33.35■■■□□ 2.93
NCOA1Q15788 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
NCOA1Q15788 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
NCOA1Q15788 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
NCOA1Q15788 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
NCOA1Q15788 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
NCOA1Q15788 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
NCOA1Q15788 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
NCOA1Q15788 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
NCOA1Q15788 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
NCOA1Q15788 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
NCOA1Q15788 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
NCOA1Q15788 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
NCOA1Q15788 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
NCOA1Q15788 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
NCOA1Q15788 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
NCOA1Q15788 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
NCOA1Q15788 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
NCOA1Q15788 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
NCOA1Q15788 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC33.33■■■□□ 2.93
NCOA1Q15788 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
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