Protein–RNA interactions for Protein: Q15629

TRAM1, Translocating chain-associated membrane protein 1, humanhuman

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM1Q15629 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAM1Q15629 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAM1Q15629 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAM1Q15629 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAM1Q15629 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAM1Q15629 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAM1Q15629 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAM1Q15629 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAM1Q15629 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAM1Q15629 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAM1Q15629 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAM1Q15629 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAM1Q15629 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAM1Q15629 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAM1Q15629 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAM1Q15629 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAM1Q15629 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAM1Q15629 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAM1Q15629 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAM1Q15629 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAM1Q15629 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAM1Q15629 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAM1Q15629 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAM1Q15629 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAM1Q15629 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAM1Q15629 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAM1Q15629 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAM1Q15629 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAM1Q15629 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAM1Q15629 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAM1Q15629 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAM1Q15629 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAM1Q15629 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAM1Q15629 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAM1Q15629 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAM1Q15629 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAM1Q15629 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAM1Q15629 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAM1Q15629 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAM1Q15629 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAM1Q15629 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAM1Q15629 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAM1Q15629 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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TRAM1Q15629 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAM1Q15629 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAM1Q15629 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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TRAM1Q15629 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAM1Q15629 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAM1Q15629 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
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TRAM1Q15629 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAM1Q15629 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAM1Q15629 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAM1Q15629 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAM1Q15629 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRAM1Q15629 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRAM1Q15629 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
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TRAM1Q15629 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
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TRAM1Q15629 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
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TRAM1Q15629 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRAM1Q15629 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
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TRAM1Q15629 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRAM1Q15629 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRAM1Q15629 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRAM1Q15629 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
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TRAM1Q15629 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRAM1Q15629 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRAM1Q15629 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRAM1Q15629 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRAM1Q15629 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRAM1Q15629 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRAM1Q15629 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRAM1Q15629 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRAM1Q15629 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRAM1Q15629 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRAM1Q15629 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRAM1Q15629 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRAM1Q15629 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRAM1Q15629 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRAM1Q15629 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRAM1Q15629 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRAM1Q15629 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRAM1Q15629 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRAM1Q15629 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRAM1Q15629 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRAM1Q15629 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
TRAM1Q15629 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRAM1Q15629 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRAM1Q15629 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
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