Protein–RNA interactions for Protein: Q15464

SHB, SH2 domain-containing adapter protein B, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHBQ15464 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SHBQ15464 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SHBQ15464 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SHBQ15464 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SHBQ15464 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SHBQ15464 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SHBQ15464 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SHBQ15464 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SHBQ15464 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SHBQ15464 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SHBQ15464 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SHBQ15464 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SHBQ15464 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SHBQ15464 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SHBQ15464 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SHBQ15464 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SHBQ15464 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SHBQ15464 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SHBQ15464 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SHBQ15464 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SHBQ15464 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SHBQ15464 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SHBQ15464 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SHBQ15464 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SHBQ15464 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SHBQ15464 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SHBQ15464 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SHBQ15464 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SHBQ15464 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SHBQ15464 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SHBQ15464 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SHBQ15464 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SHBQ15464 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SHBQ15464 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SHBQ15464 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SHBQ15464 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SHBQ15464 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SHBQ15464 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SHBQ15464 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SHBQ15464 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SHBQ15464 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SHBQ15464 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SHBQ15464 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SHBQ15464 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SHBQ15464 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SHBQ15464 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SHBQ15464 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SHBQ15464 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SHBQ15464 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SHBQ15464 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SHBQ15464 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SHBQ15464 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SHBQ15464 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SHBQ15464 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SHBQ15464 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SHBQ15464 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SHBQ15464 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SHBQ15464 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SHBQ15464 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SHBQ15464 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SHBQ15464 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SHBQ15464 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SHBQ15464 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SHBQ15464 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SHBQ15464 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SHBQ15464 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SHBQ15464 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SHBQ15464 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SHBQ15464 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SHBQ15464 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SHBQ15464 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SHBQ15464 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SHBQ15464 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SHBQ15464 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SHBQ15464 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SHBQ15464 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SHBQ15464 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SHBQ15464 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SHBQ15464 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SHBQ15464 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SHBQ15464 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SHBQ15464 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SHBQ15464 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SHBQ15464 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SHBQ15464 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SHBQ15464 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SHBQ15464 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SHBQ15464 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SHBQ15464 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SHBQ15464 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SHBQ15464 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SHBQ15464 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SHBQ15464 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SHBQ15464 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SHBQ15464 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SHBQ15464 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SHBQ15464 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SHBQ15464 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SHBQ15464 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SHBQ15464 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms