Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYTH1Q15438 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYTH1Q15438 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYTH1Q15438 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYTH1Q15438 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYTH1Q15438 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYTH1Q15438 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CYTH1Q15438 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CYTH1Q15438 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CYTH1Q15438 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CYTH1Q15438 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CYTH1Q15438 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CYTH1Q15438 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CYTH1Q15438 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYTH1Q15438 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYTH1Q15438 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYTH1Q15438 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYTH1Q15438 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYTH1Q15438 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYTH1Q15438 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYTH1Q15438 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYTH1Q15438 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYTH1Q15438 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYTH1Q15438 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CYTH1Q15438 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYTH1Q15438 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CYTH1Q15438 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYTH1Q15438 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYTH1Q15438 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYTH1Q15438 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYTH1Q15438 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYTH1Q15438 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYTH1Q15438 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYTH1Q15438 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYTH1Q15438 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYTH1Q15438 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYTH1Q15438 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYTH1Q15438 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYTH1Q15438 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYTH1Q15438 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYTH1Q15438 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYTH1Q15438 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYTH1Q15438 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYTH1Q15438 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYTH1Q15438 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYTH1Q15438 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CYTH1Q15438 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYTH1Q15438 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYTH1Q15438 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYTH1Q15438 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CYTH1Q15438 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYTH1Q15438 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CYTH1Q15438 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYTH1Q15438 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYTH1Q15438 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYTH1Q15438 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYTH1Q15438 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYTH1Q15438 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYTH1Q15438 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYTH1Q15438 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYTH1Q15438 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYTH1Q15438 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYTH1Q15438 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYTH1Q15438 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYTH1Q15438 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYTH1Q15438 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYTH1Q15438 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYTH1Q15438 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CYTH1Q15438 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYTH1Q15438 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYTH1Q15438 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYTH1Q15438 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CYTH1Q15438 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYTH1Q15438 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYTH1Q15438 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYTH1Q15438 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYTH1Q15438 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYTH1Q15438 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYTH1Q15438 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYTH1Q15438 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYTH1Q15438 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYTH1Q15438 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYTH1Q15438 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYTH1Q15438 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CYTH1Q15438 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CYTH1Q15438 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CYTH1Q15438 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYTH1Q15438 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYTH1Q15438 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYTH1Q15438 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYTH1Q15438 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYTH1Q15438 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYTH1Q15438 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYTH1Q15438 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYTH1Q15438 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYTH1Q15438 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYTH1Q15438 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYTH1Q15438 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYTH1Q15438 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CYTH1Q15438 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
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