Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHD4Q14839 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CHD4Q14839 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHD4Q14839 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHD4Q14839 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHD4Q14839 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CHD4Q14839 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CHD4Q14839 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHD4Q14839 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHD4Q14839 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHD4Q14839 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHD4Q14839 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHD4Q14839 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHD4Q14839 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHD4Q14839 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHD4Q14839 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CHD4Q14839 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHD4Q14839 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHD4Q14839 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHD4Q14839 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHD4Q14839 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHD4Q14839 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHD4Q14839 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHD4Q14839 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHD4Q14839 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHD4Q14839 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHD4Q14839 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHD4Q14839 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHD4Q14839 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHD4Q14839 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHD4Q14839 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHD4Q14839 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHD4Q14839 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHD4Q14839 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHD4Q14839 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CHD4Q14839 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHD4Q14839 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CHD4Q14839 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHD4Q14839 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHD4Q14839 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHD4Q14839 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHD4Q14839 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHD4Q14839 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CHD4Q14839 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CHD4Q14839 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CHD4Q14839 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CHD4Q14839 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHD4Q14839 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHD4Q14839 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CHD4Q14839 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHD4Q14839 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHD4Q14839 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHD4Q14839 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHD4Q14839 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHD4Q14839 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHD4Q14839 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHD4Q14839 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHD4Q14839 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHD4Q14839 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHD4Q14839 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHD4Q14839 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHD4Q14839 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHD4Q14839 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHD4Q14839 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHD4Q14839 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHD4Q14839 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHD4Q14839 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CHD4Q14839 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CHD4Q14839 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CHD4Q14839 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHD4Q14839 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHD4Q14839 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CHD4Q14839 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHD4Q14839 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHD4Q14839 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHD4Q14839 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHD4Q14839 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHD4Q14839 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHD4Q14839 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHD4Q14839 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHD4Q14839 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHD4Q14839 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHD4Q14839 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHD4Q14839 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHD4Q14839 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHD4Q14839 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHD4Q14839 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHD4Q14839 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHD4Q14839 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHD4Q14839 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CHD4Q14839 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHD4Q14839 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHD4Q14839 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHD4Q14839 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHD4Q14839 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHD4Q14839 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CHD4Q14839 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CHD4Q14839 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHD4Q14839 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHD4Q14839 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms