Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
BECN1Q14457 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
BECN1Q14457 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
BECN1Q14457 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
BECN1Q14457 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
BECN1Q14457 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
BECN1Q14457 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
BECN1Q14457 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
BECN1Q14457 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
BECN1Q14457 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
BECN1Q14457 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
BECN1Q14457 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
BECN1Q14457 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BECN1Q14457 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BECN1Q14457 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BECN1Q14457 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
BECN1Q14457 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BECN1Q14457 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BECN1Q14457 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BECN1Q14457 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BECN1Q14457 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BECN1Q14457 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BECN1Q14457 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BECN1Q14457 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BECN1Q14457 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BECN1Q14457 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
BECN1Q14457 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
BECN1Q14457 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BECN1Q14457 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
BECN1Q14457 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BECN1Q14457 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
BECN1Q14457 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
BECN1Q14457 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
BECN1Q14457 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
BECN1Q14457 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
BECN1Q14457 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
BECN1Q14457 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
BECN1Q14457 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
BECN1Q14457 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
BECN1Q14457 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
BECN1Q14457 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
BECN1Q14457 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
BECN1Q14457 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
BECN1Q14457 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
BECN1Q14457 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BECN1Q14457 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
BECN1Q14457 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
BECN1Q14457 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
BECN1Q14457 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BECN1Q14457 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BECN1Q14457 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
BECN1Q14457 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BECN1Q14457 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
BECN1Q14457 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
BECN1Q14457 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
BECN1Q14457 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
BECN1Q14457 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
BECN1Q14457 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
BECN1Q14457 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
BECN1Q14457 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
BECN1Q14457 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
BECN1Q14457 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
BECN1Q14457 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BECN1Q14457 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BECN1Q14457 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BECN1Q14457 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
BECN1Q14457 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BECN1Q14457 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BECN1Q14457 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
BECN1Q14457 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
BECN1Q14457 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
BECN1Q14457 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BECN1Q14457 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BECN1Q14457 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
BECN1Q14457 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
BECN1Q14457 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
BECN1Q14457 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
BECN1Q14457 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
BECN1Q14457 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
BECN1Q14457 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
BECN1Q14457 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
BECN1Q14457 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
BECN1Q14457 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
BECN1Q14457 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
BECN1Q14457 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
BECN1Q14457 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
BECN1Q14457 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
BECN1Q14457 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
BECN1Q14457 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
BECN1Q14457 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
BECN1Q14457 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
BECN1Q14457 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
BECN1Q14457 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
BECN1Q14457 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
BECN1Q14457 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
BECN1Q14457 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
BECN1Q14457 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
BECN1Q14457 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
BECN1Q14457 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
BECN1Q14457 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
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