Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC34.8■■■■□ 3.16
CDK13Q14004 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
CDK13Q14004 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
CDK13Q14004 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
CDK13Q14004 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
CDK13Q14004 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
CDK13Q14004 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
CDK13Q14004 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
CDK13Q14004 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
CDK13Q14004 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
CDK13Q14004 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
CDK13Q14004 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
CDK13Q14004 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
CDK13Q14004 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
CDK13Q14004 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
CDK13Q14004 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
CDK13Q14004 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
CDK13Q14004 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
CDK13Q14004 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
CDK13Q14004 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.16
CDK13Q14004 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.16
CDK13Q14004 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.16
CDK13Q14004 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.16
CDK13Q14004 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
CDK13Q14004 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
CDK13Q14004 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
CDK13Q14004 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
CDK13Q14004 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
CDK13Q14004 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
CDK13Q14004 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
CDK13Q14004 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
CDK13Q14004 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
CDK13Q14004 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
CDK13Q14004 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
CDK13Q14004 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
CDK13Q14004 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
CDK13Q14004 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
CDK13Q14004 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
CDK13Q14004 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
CDK13Q14004 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
CDK13Q14004 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
CDK13Q14004 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
CDK13Q14004 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
CDK13Q14004 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
CDK13Q14004 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
CDK13Q14004 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
CDK13Q14004 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
CDK13Q14004 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
CDK13Q14004 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC34.73■■■■□ 3.15
CDK13Q14004 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
CDK13Q14004 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
CDK13Q14004 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
CDK13Q14004 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
CDK13Q14004 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
CDK13Q14004 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
CDK13Q14004 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
CDK13Q14004 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
CDK13Q14004 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
CDK13Q14004 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
CDK13Q14004 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC34.71■■■■□ 3.15
CDK13Q14004 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
CDK13Q14004 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
CDK13Q14004 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
CDK13Q14004 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
CDK13Q14004 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
CDK13Q14004 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
CDK13Q14004 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
CDK13Q14004 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
CDK13Q14004 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
CDK13Q14004 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
CDK13Q14004 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC34.71■■■■□ 3.15
CDK13Q14004 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.7■■■■□ 3.15
CDK13Q14004 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
CDK13Q14004 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
CDK13Q14004 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.14
CDK13Q14004 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC34.7■■■■□ 3.14
CDK13Q14004 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC34.7■■■■□ 3.14
CDK13Q14004 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC34.7■■■■□ 3.14
CDK13Q14004 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC34.7■■■■□ 3.14
CDK13Q14004 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.14
CDK13Q14004 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC34.7■■■■□ 3.14
CDK13Q14004 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
CDK13Q14004 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
CDK13Q14004 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
CDK13Q14004 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
CDK13Q14004 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
CDK13Q14004 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
CDK13Q14004 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
CDK13Q14004 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
CDK13Q14004 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC34.68■■■■□ 3.14
CDK13Q14004 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
CDK13Q14004 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
CDK13Q14004 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
CDK13Q14004 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
CDK13Q14004 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
CDK13Q14004 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
CDK13Q14004 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
CDK13Q14004 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
CDK13Q14004 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
CDK13Q14004 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
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